Kromosoomide ja kromosoomide värvimise erinevus

võtme erinevus kromosoomide ribade ja kromosoomide värvimise vahel on see kromosoomiriba on värvimistehnika, mis näitab kromosoomide piirkondi eristatavates tumedates ja heledates ribades, kuid kromosoomimaalimine on hübridisatsioonitehnika, mille käigus kromosoomide konkreetsed piirkonnad või segmendid värvitakse järjestusspetsiifiliste fluorestsentsmärgistatud sondidega.

Tsütogeneetikas tuleb kromosoomide ja nende aberratsioonide tuvastamiseks toota organismi nähtav karüotüüp. Kromosoomide ribade moodustamine ja kromosoomide värvimine on kaks tsütogeneetilist tehnikat, mis aitavad kromosoome visualiseerida. Mõlemad tehnikad on kasulikud geneetiliste häirete tuvastamisel.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on kromosoomi paisumine 
3. Mis on kromosoomimaalimine
4. Sarnasused kromosoomide seondumise ja kromosoomide värvimise vahel
5. Kõrvuti võrdlus - kromosoomi seondumine vs kromosoomi maalimine tabeli kujul
6. Kokkuvõte

Mis on kromosoomi banding?

Kromosoomi ribade värvimine on värvimistehnika, mille abil kuvatakse kromosoomi pikkuses heledad ja tumedad ribad või regioonid vahelduvalt. Bänd viitab kromosoomi osale, mis on selgelt eristatav külgnevatest segmentidest tumedama või heledama kujuga. Tumedate ja heledate ribade saamiseks on vaja kromosoome värvida sobiva värvainega, näiteks fluorestsentsvärvi kinakriini või Giemsa peitsiga.

Kromosomaalse riba sidumise tehnikaid on mitut tüüpi. Nende hulgas on üldistatud ribatehnikateks Q-riba, pöörd- (R) ja G-riba. G-ribatehnikas kasutatakse peitsi, mida nimetatakse Giemsa-peitsiks, ja see värvib heterokromaatiliste piirkondade AT-rikkad piirkonnad tumeda värvusega ribades ja GC-rikkad euchromaatilised piirkonnad kergelt värvitud ribades. R-ribakujundus on G-ribaühenduse tagurpidi ja see värvib GC-rikkad piirkonnad tumedates ribades ja AT-rikkad piirkonnad kergetes ribades. Q-ribalahus seevastu kasutab fluorestsentsvärvi kinakriini ja see värvib kromosoome erineva intensiivsusega kollastes fluorestsentsides. C-ribatehnika on veel üks ribameetod, mis värvib tsentromeeri piirkondi. Lisaks visualiseerib T-ribatehnika telomeeripiirkondi.

Joonis 01: kromosoomide seondumine

Ribamuster on organismidele ainulaadne. Seetõttu on need ainulaadsed ribakujundusskeemid olulised kromosoomide tuvastamisel ja kromosoomaberratsioonide tuvastamisel (kromosoomi purunemine, kadumine, dubleerimine, translokatsioon või tagurpidi segmendid).

Mis on kromosoomimaalimine?

Kromosoomi värvimine on tehnika, milles kromosoomide spetsiifilised piirkonnad või segmendid värvitakse fluorestsentsmärgistatud järjestusspetsiifiliste sondidega. Seetõttu on kromosomaalne maalimine alati seotud in situ KALA tehnika. See põhineb täielikult molekulaarsel hübridiseerumisel kromosoomide järjestusspetsiifiliste sondidega. Seetõttu vajab see sihtkromosoomide või kromosoomipiirkondade hübridiseerimiseks spetsiifilisi sonde.

Joonis 02: kromosomaalne värvimine

Pealegi nõuab see meetod algselt metafaasis oleva sihtmärk-kromosomaalse DNA denatureerimist. Teiseks toimub hübridiseerimisetapp sondidega. Kui sondid leiavad oma komplementaarsed järjestused, hübridiseeruvad nad kromosoomi konkreetsete piirkondadega. Hübridiseeritud saite on lihtne jälgida autoradiograafia või immunofluorestsentsi abil. Sondide ettevalmistamine, denatureerimine, hübridiseerimine ja visualiseerimine on kromosomaalse värvimise neli peamist sammu.

Rakenduste osas on kromosoomimaalimine kasulik kromosomaalsete ümberkorralduste, katkestuspunktide ja kromosoomiväliste materjalide määramisel. Lisaks on see võimas vahend kromosoomide erinevate geenijärjestuste täpsel lokaliseerimisel mikroskoopilisel tasemel. Lisaks on kromosoomimaalimine kromosoomides soovitud tähtede geenide tuvastamisel kasulik.

Millised on sarnasused kromosoomide seondumise ja kromosoomide värvimise vahel?

• Kromosoomi triibutamine ja kromosoomi värvimine on kaks tsütogeneetilises analüüsis kasutatavat tehnikat.
• Mõlemad meetodid visualiseerivad kromosoome tavaliselt metafaasis.
• Need tehnikad võimaldavad tuvastada normaalseid kromosoome ja aberratsioone.
• Pealegi on need meetodid geneetiliste häirete tuvastamisel tõesti kasulikud.

Mis vahe on kromosoomide pindamisel ja kromosoomide värvimisel?

Kromosoomiriba on värvimistehnika, mis näitab kromosoomide osi tumedates ja heledates ribades, mida saab eristada. Samal ajal on kromosoomimaalimine hübridisatsioonitehnika, mis värvib kromosoomide konkreetsed piirkonnad fluorestsentsmärgistatud järjestusspetsiifiliste sondidega. Niisiis, see on peamine erinevus kromosoomide ribade ja kromosoomide värvimise vahel. Lisaks tekitab kromosoomiriba kromosoomi pikkuses vahelduvaid tumedaid ja heledaid ribasid, kromosoomi värvimine aga kromosoomide fluorestsentsmärgistatud piirkondi.

Veelgi enam, kromosoomi triibutamine sõltub kromosomaalse DNA võimest värvainega värvida, samal ajal kui kromosoomi värvimine sõltub molekulaarsest hübridisatsioonist kromosoomide järjestusspetsiifiliste sondidega. See on oluline erinevus kromosoomide ribade ja kromosoomide värvimise vahel. Lisaks neile, erinevalt kromosoomi ribadest, nõuab kromosoomi värvimise tehnika järjestusspetsiifilisi fluorestsentsmärgistatud sondid.

Kokkuvõte - kromosoomide seondumine vs kromosoomide värvimine

Kromosoomide ribade moodustamine ja kromosoomide värvimine on kaks meetodit kromosoomide visualiseerimiseks, tavaliselt metafaasis. Mõlemad tehnikad aitavad tuvastada kromosoomaberratsioone ja geneetilisi haigusi nii arvuliselt kui ka struktuurselt. Kromosoomiriba on värvimistehnika, mis kuvab eristatavad kromosoomide piirkonnad pimedates ja heledates ribades. Samal ajal on kromosomaalne värvimine hübridisatsioonitehnika tüüp, mis visualiseerib kromosoomide spetsiifilisi piirkondi hübridiseerumise tõttu fluorestsentsmärgistatud järjestusespetsiifiliste sondidega. Niisiis, see on peamine erinevus kromosoomide ribade ja kromosoomide värvimise vahel.

Viide:

1. Thomas jt. "Kromosoomimaal: kasulik kunst." OUP Academic, Oxford University Press, 1. september 1998, saadaval siin.
2. „G Banding”. Vikipeedia, Wikimedia Foundation, 19. jaanuar 2020, saadaval siin.

Pilt viisakalt:

1. Riikliku inimese genoomiuuringute instituudi “NHGRI inimese meessoost karüotüüp” - (Public Domain) Commons Wikimedia kaudu
2. “Kaelkirjaku (Giraffa camelopardalis) karüotüüp” Anastasia I Kulemzina, Polina L Perelman, Darya A Grafodatskaya, Trung T Nguyen, Mary Thompson, Melody E Roelke-Parker ja Alexander S Graphodatsky - Kulemzina AI, Perelman PL DA, Grafodatska et al. Pronghorni (Antilocapra americana) ja saola (Pseudoryx nghetinhensis) karüotüüpide võrdlev kromosoomimaalimine inimese ja dromedaarse kaamelisondiga. BMC geneetika. 2014; 15: 68. doi: 10.1186 / 1471-2156-15-68. (CC BY 2.0) Commonsi Wikimedia kaudu