Erinevus kosmiidi ja fagemiidi vahel

võtme erinevus Kosmiidi ja Phagemidi vahel on seda tüüpi järjestuste tüüp. Kosmiid sisaldab cos-saiti ja plasmiidi. Seetõttu on see hübriidvektor, samal ajal kui Phagemid on plasmiid, mis sisaldab F1 faagi replikatsiooni alguspunkti F1.

Kosmiide ​​ja fagemiide ​​kasutatakse kloonimiseks, eriti DNA suuremate fragmentide kloonimiseks. Neid kasutatakse laialdaselt, eriti kloonigeenides, mis vastutavad erinevate valkude tootmise eest. Kosmiide ​​ja fagemiide ​​korratakse kas üksi plasmiididena või pakitakse viiruseosakestesse ja replitseeritakse.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on kosmiid
3. Mis on fagemiid
4. Kosmiidi ja Phagemidi sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - tabelina esitatud Cosmid vs Phagemid
6. Kokkuvõte

Mis on kosmiid?

Cosmid, mida nimetatakse hübriidplasmiidiks, sisaldab Lambda faagiosakestest ekstraheeritud cos-saite ja plasmiidi. Need cos-saidid on pikad DNA fragmendid, millel on 200 aluspaari. Seega on neil kohesiivsed või kleepuvad otsad, mis võimaldavad plasmiidil viiruse DNA-sse mahtuda. Seetõttu on cos-saidid DNA pakendamiseks üliolulised.

Seal on kolm cos-saiti;

• cosN sait - osaleb DNA ahela nikimises terminaasi aktiivsuse kaudu
• cosB sait - tegeleb terminaasi hoidmisega.
• cosQ sait - osa DNA lagunemise ärahoidmisest DNaaside poolt.

Joonis 01: kosmiid

Samuti võivad kosmiidid kas replitseerida üheahelalist või kaheahelalist DNA-d, kasutades sobivat replikatsiooni alguspunkti. Kosmiidid sisaldavad tavaliselt transformantide valimise markeriteks antibiootikumiresistentsuse geene. Seega võib kosmiidi kasutamine vektorina hõlbustada kloonimist ja vektori lagundamine restriktsiooniensüümiga võib neid fragmente ekstraheerida.

Mis on Phagemid (Phasmid)?

Phagemid, nimetatakse ka Phasmid, on ka teatud tüüpi hübriidvektor. Phagemid sisaldab spetsiaalset replikatsiooni päritolu, mida nimetatakse replikatsiooni alguspunktiks F1. F1 replikatsiooni alguspunkt ekstraheeritakse f1 faagist.

Fagemiid võib replitseerida nii üheahelalist kui ka kaheahelalist DNA-d. Replikatsioon võib toimuda kas plasmiidina iseseisva replikatsiooni toimumise ajal või pakkida faagiosakestesse ja nakatada lõpuks bakterite peremeest E coli. Nakatumisel E coli rakkudes, nõuab f1-faag pilooni olemasolu. Seega on seksuaalsed pilid olulised in vitro Phagemiidide pakendid.

Millised on sarnasused kosmiidi ja Phagemidi vahel?

• Nii Cosmid kui ka Phagemid on kloonimisvektorid, mida kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias.
• Kosmiid ja Phagemid võivad replitseerida üheahelalist ja kaheahelalist DNAd.
• Mõlemad võivad läbi viia iseseisva replikatsiooni, mis sarnaneb plasmiididega.
• Kosmiid ja Phagemid võivad läbi minna in vitro bakterirakkude pakendamine ja nakatamine.
• Nii Cosmid kui ka Phagemid vajavad kloonimiseks sobivat replikatsiooni päritolu.

Milline on erinevus kosmiidi ja Phagemidi vahel?

Kosmiid vs Phagemid
Kosmiid on hübriidvektor, mis sisaldab cos-saiti ja plasmiidi.	Fagemiid on plasmiid, mis sisaldab F1 faagi replikatsiooni alguspunkti F1.
Cos-saitide olemasolu
Kos-saidid esinevad kosmiidis ja on vajalikud in vitro pakendamiseks.	Cos-saidid fagemiidides puuduvad.
F1 replikatsiooni päritolu olemasolu
Kosmiidi korral võib replikatsiooni algpunkt esineda või mitte.	F1 replikatsiooni alguspunkt on fagemiidides.
Antibiootikumiresistentsete geenide olemasolu
Kosmiidides esinevad antibiootikumiresistentsed geenid, et tuvastada transformante mitte-transformantide seast.	Fagemiidides puuduvad antibiootikumiresistentsed geenid.
Nõuded in Vitro pakendile
Nõuab cos saidi.	Nõuab sekspilu.

Kokkuvõte - Kosmiid vs Phagemid

Kosmiid ja Phagemid on kloonimisvektorid, mida kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias. Kosmiidid on hübriidsed vektorid, mis sisaldavad spetsiaalseid kleepuvaid otsi, mida nimetatakse kos-saitideks. in vitro pakendid vajavad neid cos saite. Kui fagemiidid on plasmiidid, mis sisaldavad f1-faagist ekstraheeritud replikatsiooni alguspunkti F1. Nii kosmiid kui ka fagemiid võivad iseseisvalt replitseeruda või in vitro pakendamine bakterirakkudesse. Need on olulised erinevused kosmiidi ja fagemiidi vahel.

Viide:

1.Qi, H, et al. “Faagi kuvamiseks mõeldud Phagemid-vektorid: omadused, omadused ja ehitus.” Journal of Molecular Biology., USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, 30. märts 2012. Saadaval siin 
2.Collins, J ja B Hohn. "Kosmiidid: tüüp plasmiidi geeni kloonimisvektorit, mis on bakteriofaagi Lambda peades in vitro pakendatav." Ameerika Ühendriikide Riikliku Teaduste Akadeemia toimetised, USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, september 1978. Saadaval siin  

Pilt viisakalt:

1.'Cosmid (inglise keeles) 'autor Zlir'a (CC0) Commonsi Wikimedia kaudu