Transkriptsioon on kodeerivas DNA järjestuses salvestatud geneetilise teabe muundamine mRNA järjestuseks. Spetsiifiline DNA piirkond, mis asub transkriptsiooniüksuse 5'-otsas, käivitab selle protsessi. Seda piirkonda nimetatakse promootorpiirkonnaks. Need promootorid asuvad tavaliselt transkriptsiooni alguskoha läheduses. Promootori pikkus varieerub vahemikus 100 bp kuni 1000 bp. Promootorid on tüübiorganismi järgi erinevad. Eukarüootsed ja prokarüootsed promootorid erinevad üksteisest. Prokarüootides leitakse ainult kolme tüüpi promootorjärjestusi, nimelt -10 promootors, -35 promootorit ja ülesvoolu elemente. Sisse eukarüootid, seal on palju erinevaid promootorielemente nagu TATA kast, algataja elemendid, GC kast, CAAT kast jne. See on võtme erinevus eukarüootsete ja prokarüootsete promootorite vahel.
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on eukarüootide promootorid
3. Mis on prokarüootilised promootorid
4. Eukarüootiliste ja prokarüootsete promootorite sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - tabeli kujul eukarüootsed vs prokarüootilised promootorid
6. Kokkuvõte
Kolm peamist osa; tuum promootor, proksimaalne promootor ja distaalne promootor moodustavad kollektiivselt promootori. Eukarüootide kontekstis leitakse palju promootorielemente, mis on promootoritest väga keerukad ja mitmekesisemad. On selgunud, et eukarüootsete promootorite keerukuse tõttu on DNA-l võime end tagasi pöörata. See seletab ka tõsiasja, et paljude regulatoorsete järjestuste mõju avaldub isegi siis, kui nad asuvad transkriptsiooni kohast paljudest kilobaasidest eemal. Nendel eukarüootsetel promootoritel on võime hõlmata mitmesuguseid DNA järjestusi.
Joonis 01: eukarüootide promootor
Mõnede eukarüootsete promootorite näited on Pribnow kast (TATA kast), GC kast, CAAT kast jne. TATA lahter, see on 5 '- TATAA -3' järjestus, mis asub tuuma promootori piirkonnas. TATA kasti on seotud transkriptsioonifaktori valgud ja histooni valgud. Transkriptsioonifaktori valkude sidumine TATA kastiga aitab kaasa RNA polümeraasi sidumisele, mille tulemuseks on transkriptsioonikompleksi moodustumine. Lihtsamalt öeldes juhib nende valkude seondumine transkriptsiooni protsessi. See protsess on pärsitud, kui histooni valgud seotakse TATA kasti. Seetõttu on TATA kast oluline promootori element, mis hõlmab eukarüootse transkriptsiooni kiiruse reguleerimist.
Prokarüootilistes organismides identifitseeritakse transkriptsioonis osalev promootor seotud faktoriga, mida nimetatakse sigmafaktoriks. Sigma tegurid on eri promootorjärjestuste jaoks ainulaadsed. Seetõttu öeldakse, et iga üksik sigmafaktor tunneb ära ühe tuuma promootorjärjestuse. See on ainulaadne omadus, mis esineb prokarüootses transkriptsiooniprotsessis. Nii RNA polümeraas kui ka sigmafaktor identifitseerivad ühiselt õige promootori piirkonna ja moodustavad transkriptsioonikompleksi.
Prokarüootne promootor sisaldab ainult kolme tüüpi promootori elemente. Promootorielementide väiksem osalus prokarüootides on peamine põhjus, miks nende transkriptsiooniprotsess on vähem keerukas, võrreldes eukarüootse transkriptsiooniga, mis hõlmab suuremat arvu promootorjärjestusi. Prokarüootide kolmest promootori elemendist on kaks peamist olulist kahte lühikest DNA järjestust. Need järjestused klassifitseeritakse vastavalt nende asukohale. Nad on -10 promootorit või elementi (see on transkriptsiooni alguskohast 10 bp ülesvoolu), -35 promootorit või elementi (see on 35 bp transkriptsiooni alguskohast ülesvoolu).
Joonis 02: prokarüootne promootor
-10 promootor on samaväärne eukarüootse TATA kasti või Pribnovi boksiga ja on oluline komponent transkriptsiooni algatamiseks prokarüootides. Promootor -35 koosneb TTGACA järjestusest, mis osaleb aktiivselt prokarüootse transkriptsiooni kiiruse reguleerimises.
Eukarüootsed vs prokarüootilised promootorid | |
Eukarüootsed promootorid on regulatoorsed järjestused, mis algatavad eukarüootsete organismide transkriptsiooni. | Prokarüootsed promootorid on regulatoorsed järjestused, mis algatavad prokarüootsete geenide transkriptsiooni. |
Elemendid | |
Prokarüootne promootor koosneb ülesvoolu elementidest, -10 elemendist ja -35 elemendist. | Eukarüootiline promootor koosneb Pribnovi kastist (TATA kast), CAAT kastist, GC karbist ja initsiaatorielementidest. |
Promootor on DNA piirkond, mis hõlmab protsessi, mida nimetatakse transkriptsiooniks, käivitamist. Need promootorid leitakse tavaliselt transkriptsiooni alguskohast ülesvoolu. Kolm peamist osa, mis moodustavad promootori, on tuuma promootor, proksimaalne promootor ja distaalne promootor. Eukarüootide kontekstis on promootoripiirkonnas palju propageerivaid elemente, mis on väga keerukad ja mitmekesisemad kui prokarüootid. Mõnede eukarüootiliste promootorielementide näideteks on Pribnow-kast (TATA-kast), GC-kast, CAAT-kast jne. Prokarüootides on kaks peamist promootori elementi, nimelt -10 element (see on transkriptsiooni alguskohast 10 bp ülesvoolu), -35 elementi (see on transkriptsiooni alguskohast ülesvoolu 35 bp). -10 promootor initsieerib transkriptsiooni ja -35 promootor reguleerib transkriptsiooni. Mõlemat tüüpi promootoreid kontrollivad erinevad DNA regulatoorsed järjestused, mis hõlmavad tugevdajaid, summuteid, isolaatoreid ja piirielemente. See on erinevus eukarüootiliste ja prokarüootsete promootorite vahel.
Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja seda võrguühenduseta otstarbel kasutada tsitaatide märkuse kohaselt. Laadige alla PDF-versioon siit: Erinevus eukarüootiliste ja prokarüootiliste promootorite vahel
1.Kanhere, A. “Promootorite struktuurilised omadused: sarnasused ja erinevused prokarüootide ja eukarüootide vahel.” Nucleic Acids Research, vol. 33, nr. 10, veebruar 2005, lk 3165-3175., Doi: 10.1093 / nar / gki627.
2. “Korraldajad”. Addgene. Saadaval siin
1. 'Geenistruktuuri eukarüoot 2 märkustega', autoriteks Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). “Eukarüootne ja prokarüootne geenistruktuur”. Meditsiini WikiJournal 4 (1). DOI: 10.15347 / wjm / 2017.002. ISSN 20024436., (CC BY 4.0) Commonsi Wikimedia kaudu
2.'Figuur 15 02 01 ': CNX OpenStax, (CC BY 4.0) Commonsi Wikimedia kaudu