Üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite erinevus

Peamine erinevus - üldine vs konkreetsed transkriptsioonifaktorid
 

RNA polümeraas nõuab transkriptsioonifaktorite toimimist mRNA sünteesimisel DNA matriitsi ahelale. Transkriptsioonifaktoreid on erinevat tüüpi. Need transkriptsioonifaktorid moodustavad DNA ahelaga kompleksi. Nad kas muudavad matriitsi ahela kinnitust või suurendavad RNA polümeraasi ensüümi afiinsust mRNA sünteesi suhtes nn transkriptsiooni protsessis. Transkriptsioonifaktorid on kahte tüüpi. Need on üldised või basaalsed transkriptsioonifaktorid ja spetsiifilised transkriptsioonifaktorid. Üldised transkriptsioonifaktorid on tegurid, mida kasutatakse eelinitsiatsioonikompleksi moodustamiseks transkriptsiooni käigus. Neid esineb peaaegu kõigis eukarüootides ja prokarüootides moodustavad nad vähem keeruka kompleksi. Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on kas võimendajad või repressorid, mis on spetsiifilised DNA järjestused, mis aktiveerivad või represseerivad üldist transkriptsiooniprotsessi. Mõned spetsiifilised transkriptsioonifaktorid võivad muuta DNA järjestust ennast. võtme erinevus üldiste transkriptsioonifaktorite ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel põhineb funktsionaalsusel. Transkriptsiooniprotsessi eelinitsiatsioonikompleksi moodustamises osalevad üldised transkriptsioonifaktorid, samal ajal kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid osalevad transkriptsiooniprotsessi aktiveerimises või mahasurumises.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on üldised transkriptsioonifaktorid
3. Mis on spetsiifilised transkriptsioonifaktorid
4. Üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - üldised vs spetsiifilised transkriptsioonifaktorid tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on üldised transkriptsioonifaktorid?

Üldine või Baasülekande tegurid on faktorid, mis on transkriptsiooni ajal seotud initsiatsioonikompleksi moodustumisega. Need on transkriptsiooniprotsessi jaoks üliolulised, seetõttu mängivad nad eduka transkriptsiooni jaoks üliolulist rolli. Siin on kuus peamist transkriptsioonifaktorit. Nemad on; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF ja TFIIA. Nad mängivad initsiatsioonikompleksi moodustamisel erinevaid rolle.

1. TFIID - See transkriptsioonifaktor (TF) on seotud promootori järjestuse äratundmisega (TATA kast).
2. TFIIB - Promootori / TFIID kompleksi tunnistab TFIIB. See annab signaali peamise katalüüsiva ensüümi RNA polümeraasi sidumiseks.
3. TFIIF - See transkriptsioonifaktor on seotud RNA polümeraasiga. Seega osaleb TFIIF protsessis, värvates RNA polümeraasi õigesse kohta.
4. TFIIE ja TFIIH - Nende transkriptsioonifaktorite seondumine tähistab eelinitsiatsiooni moodustumise lõppu. Nende sidumine suurendab eelinitsiatsiooni kompleksi moodustumise efektiivsust.
5. TFIIA soodustab TFIID sidumist TATA kastiga.

Joonis 01: Üldised transkriptsioonifaktorid

Ülalnimetatud üldised transkriptsioonifaktorid on spetsiifilised RNA polümeraasi II suhtes, mis on RNA polümeraasi tüüp, mis pikendab mRNA ahelat. RNA polümeraas I ja III on seotud üldiste transkriptsioonifaktoritega. Üldised transkriptsioonifaktorid võivad samuti erineda sõltuvalt raku tüübist, millele see toimib.

Millised on spetsiifilised transkriptsioonifaktorid?

Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on piirkonnad, mis asuvad ka DNA järjestustes. Nad on enamasti kas tugevdajad või represseerijad. Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on spetsiifilised cis-toimivad elemendid matriits-DNA ahelas, mis läbivad transkriptsiooni. Nende spetsiifiliste võimendajate ja repressorite aktiveerimine osaleb ensüümi afiinsuse suurendamisel, muutes DNA molekuli orientatsiooni või toimides signaalipiirkondadena. Spetsiifilisi transkriptsioonifaktoreid kasutatakse ka DNA matriitsi ahela modifikatsioonide esilekutsumiseks. Need modifikatsioonid hõlmavad peamiselt kovalentseid modifikatsioone nagu metüleerimine. Seeläbi toimivad metüleeritud DNA piirkonnad transkriptsiooniprotsessi spetsiaalsete võimendajate või represseerijatena.

Joonis 02: Transkriptsiooni spetsiifilised tegurid

Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid sõltuvad liikide tüübist ja neid ei leidu tavaliselt kõigis eukarüootides. Neid transkriptsioonifaktoreid aktiveerivad erinevad metaboolsed tingimused signaali ülekanderadade kaudu. Aktiveerimisel reguleerivad nad geeni ekspressiooni transkriptsiooni tasemel.

Millised on üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite sarnasused?

• Mõlemad tegurid on transkriptsiooni protsessis vajalikud.
• Mõlemad tegurid mõjutavad organismi geeniekspressiooni.
• Mõlemad tegurid aitavad reguleerida RNA polümeraasi funktsiooni transkriptsiooniprotsessis.
• Mõlemad tegurid esinevad enamasti eukarüootides.

Mis vahe on üldistel ja spetsiifilistel transkriptsioonifaktoritel??

Üldine vs spetsiifiline transkriptsioon
Üldised transkriptsioonifaktorid on tegurid, mida kasutatakse eelinitsiatsioonikompleksi moodustamiseks transkriptsiooni käigus.	Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on kas võimendajad või repressorid, mis on spetsiifilised DNA järjestused, mis aktiveerivad või represseerivad üldist transkriptsiooniprotsessi.
Molekuli tüüp
Üldised transkriptsioonifaktorid on valgupõhised.	Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on nukleotiidjärjestused.
Moodustamine
Üldised transkriptsioonifaktorid moodustavad transkriptsiooni initsiatsiooni ajal initsiatsioonieelse kompleksi.	Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid toimivad transkriptsiooni tugevdajana või represseerijana.
Tüübid
Seal on kuus peamist tüüpi; Üldiste transkriptsioonifaktorite TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE ja TFIIA.	Spetsiifilisi transkriptsioonifaktoreid liigitatakse peamiselt tugevdajateks ja repressoriteks.

Kokkuvõte - üldine vs konkreetsed transkriptsioonifaktorid

Transkriptsioonifaktorid on transkriptsiooniregulatsiooni jaoks olulised ja vajalikud protsessi tõhustamiseks ja täpsuse suurendamiseks. Transkriptsioonifaktorid on kaks peamist tüüpi; Üldine / põhiline ja konkreetne. Üldised transkriptsioonifaktorid on kaasatud initsiatsioonieelse kompleksi moodustamisse transkriptsiooni ajal, samas kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on DNA enda piirkonnad, mis toimivad võimendajate või repressioonidena. Üldised transkriptsioonifaktorid põhinevad valkudel ja neid nõuavad kõik eukarüootid. Seda ei varieerita laialt ja see jääb ühtlaste molekulideks. Spetsiifiline transkriptsioonifaktor võib olla väga erinev ja sõltub inimese geneetilisest ülesehitusest. See on erinevus üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel.

Laadige alla üldiste vs spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite PDF-versioon

Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja seda võrguühenduseta otstarbel kasutada tsitaatide märkuse kohaselt. Laadige alla PDF-versioon siit. Üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite erinevus

Viide:

1.Pulverer, Bernd. "Järjestusspetsiifilised DNA-d siduvad transkriptsioonifaktorid." Loodusuudised, Looduskirjastusgrupp. Saadaval siin 
2. “Transkriptsioonifaktorid - geenispetsiifilised tegurid suurendavad transkriptsioonimäärasid erinevalt.” DNA, seob, promootor ja seob - JRanki artiklid. Saadaval siin  
3.Orfaniidid, G, et al. "RNA polümeraasi II üldised transkriptsioonifaktorid." Geenid ja areng, Cold Spring Harbor Lab. Saadaval siin  

Pilt viisakalt:

1. ArhiLH - "Alustamiskompleks" - Oma töö, (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu  
2. 'Transkriptsioonifaktori roll geeniekspressiooni regulatsioonis', autorid Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovjev, vähi arvutisüsteemid Chapman ja Hall / CRC matemaatiline ja arvutusbioloogia, 2012, 2012, (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu