Geneetilise kaardi ja füüsikalise kaardi erinevus

võtme erinevus genoomikaardi ja füüsilise kaardi vahel on genoomi kaardistamisel kasutatavad tehnikad. Geneetilise kaardi genereerimisel kasutatakse geenide seostumise mustrite uurimiseks geneetilisi markereid ja geneetilisi lookuseid, samas kui füüsilisel kaardistamisel kasutatakse molekulaarbioloogia tehnikaid, näiteks Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ja hübridisatsiooni tehnikaid..

Geneetilised kaardid ja füüsikalised kaardid on kahte tüüpi kaarte, mis konstrueerivad kromosoomides paiknevate geenide kuvamist. Need hõlmavad geneetilist diagnostikat ja genoomi analüüsi arengu prognoosimist. Lisaks kasutavad nad geenide lookuste vaheliste kauguste ja geenide polümorfismide analüüsimist.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on geneetiline kaart
3. Mis on füüsiline kaart
4. Geneetilise kaardi ja füüsilise kaardi sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - geneetiline kaart vs füüsiline kaart tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on geneetiline kaart?

Geneetiline kaart põhineb geenide lookuste asukohtadel ja geneetilistel markeritel, mis on tuvastatud sidemete analüüsi ja geenide assotsiatsiooni uuringute abil. Mendeli geneetika selgitab geneetilisi kaarte ja Gregor Mendel on inimene, kes selle mõiste tutvustas. Geneetiline kaart on kasulik kromosoomi asukohtade ja geenide uurimisel, mis on seotud konkreetsete tunnuste tekkega. Need geenid, mille tütarpõlvkonnad pärandasid, identifitseeritakse seejärel konkreetse haiguse või iseloomu geneetiliste markeritena.

Joonis 01: geneetiline kaart

Enne geneetilise kaardi koostamist on vaja mitut põlvkonda paljundamise tehnikat ja seejärel konkreetse tunnuse või tunnuse aretusmustrite analüüsimist. Samuti toetavad geenide assotsiatsiooni uuringud erinevate alleelide tuvastamist, mis vastutavad geneetilise kaardistamise konkreetsete pärimismustrite eest. Alleeli sagedused ja geenide sagedused aitavad ennustada kromosoomis oleva konkreetse geeni geenikaarti.

Mis on füüsiline kaart?

Geenide füüsikalised kaardid konstrueeritakse kasutades molekulaarbioloogilisi tehnikaid, näiteks restriktsiooniensüümi lagundamist jne, piirangute kaart on selle kaardi teine ​​nimi. Füüsikalise kaardi koostamisel lõikasid restriktsiooniensüümid alguses DNA fragmentideks. Seejärel eraldatakse need fragmendid geelelektroforeesi teel. Järgmine samm on DNA füüsilise kaardi genereerimine. Järgmise sammuna võib neid pärast hübridiseerimist puhastada blotimise meetoditega. Praegu on geneetiliste markeritena kasutatavate füüsiliste kaartide genereerimisel kasutusel suure läbilaskevõimega tehnikad, näiteks fluorestsentsi in situ hübridisatsioon..

Joonis 02: Füüsiline kaart

Füüsikalised kaardid on täpsem ja kiirem võrreldes geneetiliste kaartidega. Seetõttu on nende kasutamine geenipolümorfismi analüüsimisel geenikaartidega võrreldes kõrge. Füüsilisel kaardistamisel ei võeta arvesse ka Mendeli geneetilisi mustreid.

Millised on geneetilise kaardi ja füüsilise kaardi sarnasused?

• Mõlemad kaardid hõlmavad geneetiliste markerite iseloomustamist.
• Geenivaramu uuringutes kasutatakse mõlemat kaarti.
• Geneetiline kaart ja füüsiline kaart on geenidiagnostikas kasulikud.

Mis vahe on geneetilisel kaardil ja füüsikalisel kaardil??

Geneetiline kaart on geenikaart, mis põhineb geenide seostumise ja geenide seostamise uuringutel, mis on tehtud kromosoomi geneetilise markeri või geeni lookustega. Füüsiline kaart on geenikaart, milles geenikaart saadakse füüsiliselt, eraldades DNA ja saades täpse geneetilise markeri, kasutades molekulaarbioloogia tehnikaid. Nendes kahes kaardis kasutatud tehnikate osas on geneetilise kaardi ja füüsikalise kaardi erinevus selles, et geneetiline kaart kasutab geenide seostumise ja geenide assotsieerimise analüüsimeetodeid, füüsikaline kaart aga restriktsiooni kaardistamise ja hübridiseerimise tehnikaid. Seetõttu on geneetilise kaardi täpsus madal, samas kui füüsikalise kaardi täpsus.

Kui võrrelda nendes kahes kaardis kasutatud meetodite kiirust, on geneetilisel kaardil vähem kiireid, aeganõudvaid tehnikaid. Füüsilisel kaardil on aga väga kiired tehnikad. Järelikult on geneetiline kaart vähem efektiivne, samas kui füüsiline kaart on väga tõhus. Lisaks põhinevad geenikaardid Mendeli pärimismustritel, samas kui füüsilised kaardid ei põhine otseselt Mendeli pärimismustritel.

Kokkuvõte - geneetiline kaart vs füüsiline kaart

Geenivaramu uuringutes kasutatakse kromosoomides paiknevaid geneetilisi markereid. Nende markerite uurimiseks tuleb need eri tehnikaid kasutades kaardistada. Mendeli geneetika on geneetiliste kaartide alus. Geneetilise kaardistamise käigus uuritakse paljude põlvkondade vältel erinevaid tunnuseid ja geene analüüsitakse geenide seostumise ja geenide seostamise uuringute abil. Seevastu füüsikalised geenikaardid hõlmavad geneetiliste markerite eraldamist ja iseloomustamist füüsiliselt nende eraldamise teel. See on peamine erinevus geneetilise kaardi ja füüsilise kaardi vahel.

Viide:

1.O'Rourke, Jamie A. “Geneetilise ja füüsikalise kaardi korrelatsioon.” Bioteaduste entsüklopeedia, november 2014. Saadaval siin   
2. „Geneetilise kaardistamise teabeleht”. Riiklik inimese genoomi uurimise instituut (NHGRI). Saadaval siin 

Pilt viisakalt:

1.'Fail: NHGRI infoleht - geneetiline kaardistamine (27058469495) ', National Human Genom Research Institute (NHGRI), Bethesda, MD, USA - NHGRI infoleht: Geneetiline kaardistamine, (CC BY 2.0) kaudu Commons Wikimedia 
2.'Inimlik kromosoom Y - 400 550 850 bphs'By National Institute of Biotechnology Information Center, USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu (Public Domain) via Commons Wikimedia