Haplogrupi ja Haplotüübi erinevus

võtme erinevus haplogrupi ja haplotüübi vahel on see haplogrupp viitab sarnaste haplotüüpide rühmale, millel on ühine esivanem, samas kui haplotüüp viitab alleelide kogumile, mis on geneetiliste sidemete tõttu päritud koos põlvest põlve.

Geen koosneb peamiselt kahest alleelist. Kromosoomides on tuhandeid geene. Eraldamisel näitavad nad ristandusid ja geneetilisi rekombinatsioone. Mõned geenide alleelid asuvad aga üksteisele väga lähedal. Lihtsamalt öeldes näitavad need alleelid geneetilist sidet. Seega ei saa nad tõenäoliselt ristuda ega rekombineeruda. Selle asemel kipuvad nad alati põlvest põlve edasi kandma. Vastavalt sellele on haplotüüp samas kromosoomis esinevate alleelide kombinatsioon või üksikute nukleotiidide polümorfismide kogum, mis päritakse koos põlvkondade jooksul ühelt vanemalt. Haplogrupp on rühm sarnaseid haplotüüpe, millel on ühine esivanem.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on Haplogroup? 
3. Mis on hiplotüüp
4. Haplogrupi ja Haplotüübi sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - Haplogroup vs Haplotype tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on Haplogroup?

Haplogrupp on rühm sarnaseid haplotüüpe, millel on ühine esivanem. Teisisõnu, haplogrupp on erinevates kromosoomides esinevate alleelide kombinatsioon, mis päritakse koos. Need alleelid asuvad üksteisele väga lähedal. Haporühma haplotüüpidel on sarnased mustrid ja nad on omavahel seotud järeltulijad, kuna neil on ühine esivanem. Seega on haplotüüpide põhjal haplogruppi lihtne ennustada.

Joonis 01: Haplogrupp

Inimesel on kaks levinumat haplogruppi. Need on Y-kromosoomi haplogrupid, mis liiguvad isalt pojale, ja mitokondriaalsed DNA haplogrupid, mis liiguvad emalt tütrele või pojale.

Mis on Haplotüüp?

Haplotüüp on koos päritud alleelide kogum. Need alleelid asuvad geneetilise sideme tõttu samas kromosoomis üksteisega väga lähedal. Seetõttu pole rekombinatsiooni ega ristumise võimalust. Seega liiguvad nad põlvest põlve edasi. Need alleelid võivad olla ühe geeni alleelid või mitmete geenide alleelid. Haplotüüp võib osutada ka samas kromosoomis paiknevate üksikute nukleotiidide polümorfismide rühmale. Seega on need DNA variatsiooni või polümorfismide kogum, mis on päritud koos.

Joonis 02: Üksiku nukleotiidi polümorfism

Teave haplotüüpide kohta on kasulik geenide mõju uurimisel haigustele. Haplotüüpide ja haplotüüpide puude analüüsimisel saavad geneetikud tuvastada haigusega seotud genoomi piirkonnad ja määrata haigustega seotud geneetilise variatsiooni mustrid. Veelgi enam, need on kasulikud geenide kaardistamisel, kui geenimarkereid asetatakse kromosoomide õigesse kohta.

Millised on Haplogrupi ja Haplotüübi sarnasused?

• Haplogrupp koosneb sarnastest haplotüüpidest.
• Need näitavad geneetilisi sidemeid.
• Haplotüüpide ja haplogruppide korral puuduvad ristandid või geneetiline rekombinatsioon.

Mis vahe on Haplogrupi ja Haplotüübi vahel??

Haplogrupp on erinevates kromosoomides esinevate alleelide kombinatsioon, mis pärandub koos. See koosneb sarnastest haplotüüpidest, millel on ühine esivanem. Haplotüüp seevastu on samas kromosoomis leiduvate alleelide kogum, mis pärandub koos põlvkondade kaupa. Niisiis, see on peamine erinevus haplogrupi ja haplotüübi vahel.

Allpool olev infograafik võtab kokku haplogrupi ja haplotüübi erinevuse.

Kokkuvõte - Haplogroup vs Haplotype

Haplogrupp on rühm sarnaseid haplotüüpe, millel on ühine esivanem. Haplotüüp on teiselt poolt alleelide kombinatsioon või samas kromosoomis esinevate üksikute nukleotiidide polümorfismide komplekt, mida antakse põlvkondade kaupa üksikult. Seetõttu on see peamine erinevus haplogrupi ja haplotüübi vahel. Haplotüübid pakuvad lihtsat viisi haplogruppide ennustamiseks, kuna haplogrupp koosneb sarnastest haplotüüpidest.

Viide:

1. “Haplotüüp”. Genome.gov, saadaval siit.
2. “Haplogrupp”. Vikipeedia, Wikimedia Foundation, 8. juuli 2019, saadaval siin.

Pilt viisakalt:

1. Wobble'i "molekulaarne liini" - Commons Wikimedia kaudu oma töö (avalik omand)
2. “Dna-SNP” SNP mudeli järgi autor David Eccles (veski) (CC BY 4.0) Commonsi Wikimedia kaudu