Erinevus sisestus- ja asendusvektorite vahel

võtme erinevus insertsiooni- ja asendusvektorite vahel seisneb selles, et insertsioonivektoril on võime sisestada mõõduka pikkusega võõrast DNA-d, samas kui asendusvektoril on võime mahutada suurema pikkusega võõrast DNA-d.

Faagi vektorid on kloonimiseks kasutatavad bakteriofaagid. Faagivektoreid on kahte tüüpi; nad on insertsioonivektor ja asendusvektor. Samuti koosnevad kõik faagi vektorid vähemolulistest geenidest. Need geenid tuleb aga eemaldada faagidest, et hõlbustada uute võõraste DNA sisestuste tegemist.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on sisestusvektorid
3. Mis on asendusvektorid
4. Sarnasused sisestamise ja asendamise vektorite vahel
5. Kõrvuti võrdlus - sisestamine vs asendusvektorid tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on sisestusvektor?

Esiteks on insertsioonvektor lambda kloonimisvektorite lihtsaim vorm. Tegelikult on see teatud tüüpi faagi vektor, mille valikulise DNA asukohas on vektori genoomi sisestatud ainulaadne restriktsioonisaidi. Lisaks jääb faagi DNA eemaldamata. Faagi DNA selline eemaldamata jätmine vähendab vektorisse kloonitavate insertide (võõras DNA) suurust. Lisaks on need vektorid kasulikud cDNA kloonimisel ja ekspresseerimisel. Selle vektori näited on GT10, GT11 ja Zap.

Joonis 01: lambdafaag

Sisestusvektor koosneb ühest tuvastamiskohast. Selle vektori peamine ülesanne on eukarüootsetest mRNA järjestustest saadud cDNA raamatukogude arendamine. Veelgi enam, see mahutab ainult võõra DNA pikkusi vahemikus 05-11 kb. Samuti omab see ainulaadset lõhustumissaiti võõra DNA sisestamiseks.

Mis on asendusvektorid?

Asendusvektor või asendusvektor "Faagi vektor" on faagivektori tüüp, mis on välja töötatud faagi DNA keskmise "täitefragmendi" piirkonna eemaldamisel. Soovitud võõras DNA insert asendab faagi DNA.

Joonis 02: Asendusvektor

Asendusvektorid on olulised selliste genoomsete raamatukogude nagu EMBL4 ja Charon40 loomisel. Need vektorid mahutavad suurema pikkuse võõrast DNA-d, ulatudes vahemikku 08-24 kb. Täitepiirkond koosneb ka geenist, mis muudab faagivektori bakteriaalse peremehe sees elujõuetuks.

Millised on sisestamise ja asendamise vektorite sarnasused?

• Sisestus- ja asendusvektorid on faagi vektorid.
• Mõlemad vektorid mahutavad võõraid DNA inserte.
• Mõlemad on abiks DNA raamatukogude loomisel.

Mis vahe on sisestus- ja asendusvektoritel??

Sisestus vs asendusvektorid
Insertsioonivektor on teatud tüüpi faagi vektor, mille faagigenoomi on valikulise DNA kohale sisestatud restriktsioonisaidid.	Asendusvektor on teatud tüüpi faagi vektor, mis on välja töötatud faagi DNA keskmise 'täitefragmendi' piirkonna eemaldamisel
Sisestatavate fragmentide suurus
Pikkus 5–11 kb	Pikkus 08–24 kb
Täitefragment
Täiteaine fragment puudub	Täiteaine fragment asendatakse võõra insertiga
Funktsioon
Oluline on cDNA raamatukogude loomine	Tähtis genoomi raamatukogude loomisel
Näited
Näited on GT10, GT11 ja Zap	EMBL4 ja Charon40 on näited
Lõhkumiskoht
Esineb ainulaadne lõhustumissait	Lõhustumiskoht sisaldab geene, mis pole lüütilise tsükli jaoks olulised

Kokkuvõte - sisestamine vs asendusvektorid

Nii insertsiooni- kui ka asendusvektorid on kahte tüüpi faagivektorid. Mõlemal vektoril on restriktsioonisaidid, mis hõlbustavad uute võõraste DNA insertide paigutamist. Sisestusvektorid on olulised cDNA raamatukogude loomisel, asendusvektorid aga genoomsete raamatukogude loomisel. Lisaks mahutavad insertsioonivektorid mõõduka pikkusega DNA inserte. Kuid asendusvektorid mahutavad suurema pikkusega võõraid DNA inserte. Üldiselt on see peamine erinevus insertsiooni- ja asendusvektorite vahel.

Viide:

1. Hasty, P, et al. "Sisestamise tõhusus versus asendusvektori sihtimine varieerub erinevates kromosomaalsetes lookustes." Molecular and Cellular Biology, USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, detsember 1994, saadaval siin.
2. “Lambda sisestamisvektorid”. Bioloogia 335 loengumärkused - Lambdavektorid, saadaval siit.
3. “Asendusvektor”. Asendusvektor - Asendusvektori - GenScript molekulaarbioloogia terminoloogia, saadaval siit.

Pilt viisakalt:

1. Lambda faag Lizanne Koch - oma töö ChemBioDraw (Public Domain) kaudu Commonsis Wikimedia