Erinevus integreeritud valkude ja perifeersete valkude vahel

Integreeritud valgud vs perifeersed valgud

Valke peetakse makromolekulideks, mis koosnevad ühest või mitmest polüpeptiidahelast. Polüpeptiidahelad koosnevad aminohapetest, mis on omavahel seotud peptiidsidemetega. Valgu primaarstruktuuri saab määrata aminohappejärjestuse järgi. Teatud geenid kodeerivad paljusid valke. Need geenid määravad aminohappejärjestuse, määrates seeläbi nende primaarse struktuuri. Integreeritud ja perifeerseid valke peetakse nende esinemise tõttu plasmamembraanivalkudeks. Need valgud vastutavad üldiselt raku võime eest suhelda väliskeskkonnaga.

Integreeritud valk

Integreeritud valgud leitakse peamiselt kas täielikult või osaliselt plasmamembraani fosfolipiidide kaksikkihis. Nendel valkudel on nii polaarsed kui ka mittepolaarsed piirkonnad. Polaarpead ulatuvad kahekihilisest pinnast välja, samal ajal kui sellesse on sulandunud mittepolaarsed piirkonnad. Tavaliselt interakteeruvad plasmamembraani hüdrofoobse südamikuga ainult mittepolaarsed piirkonnad, luues fosfolipiidide rasvhapete sabadega hüdrofoobseid sidemeid.

Terviklikke valke, mis hõlmavad kogu membraani sisepinnalt välispinnale, nimetatakse transmembraanseteks valkudeks. Transmembraansetes valkudes on mõlemad lipiidikihist väljaulatuvad otsad polaarsed või hüdrofiilsed piirkonnad. Keskmised piirkonnad on mittepolaarsed ja nende pinnal on hüdrofoobsed aminohapped. Kolme tüüpi interaktsioonid aitavad neid valke lipiidsetesse kaksikkihti kinnistada, nimelt ioonilised interaktsioonid fosfolipiidimolekulide polaarsete peadega, hüdrofoobsed koostoimed fosfolipiidimolekulide hüdrofoobsete sabadega ja spetsiifilised interaktsioonid lipiidide, glükolipiidide või oligosahhariidide teatud piirkondadega..

Perifeerne valk

Perifeersed valgud (välised valgud) esinevad fosfolipiidide kahekihilises sisemises ja välimises osas. Need valgud on plasmamembraaniga lõdvalt seotud kas otse interaktsioonide kaudu kahekihilise fosfolipiidide polaarsete peadega või kaudselt interaktsioonide kaudu integreeritud valkudega. Need valgud moodustavad umbes 20-30% kogu membraanivalkudest.

Enamik perifeerseid valke on membraani sisemisel pinnal või tsütoplasmaatilisel pinnal. Need valgud on piiratud kas kovalentsete sidemete kaudu rasvaheladega või oligosahhariidi kaudu fosfolipiidideks.

Mis vahe on integreeritud ja perifeersel valgul??

• Perifeersed valgud esinevad plasmamembraani pinnal, terviklikud valgud aga kas täielikult või osaliselt sukelduvad plasmamembraani lipiidikihti.

• Perifeersed valgud on lipiidide kaksikkihiga lõdvalt seotud ega interakteeru fosfolipiidide kahe kihi vahel hüdrofoobse tuumaga. Integreeritavad valgud on seevastu tihedalt seotud ja interakteeruvad otseselt plasmamembraani hüdrofoobse südamikuga. Nendel põhjustel on integreeritud valkude dissotsiatsioon raskem kui perifeersed valgud.

• Perifeersete valkude eraldamiseks plasmamembraanist võib kasutada kergeid ravimeetodeid, kuid integreeritud valkude eraldamiseks ei piisa kergetest ravimeetoditest. Hüdrofoobsete sidemete purustamiseks on vaja kasutada detergente. Seega saab integreeritud valke plasmamembraanist eraldada.

• Pärast nende kahe valgu eraldamist plasmamembraanist saab perifeersed valgud lahustada neutraalsetes vesipuhvrites, samal ajal kui integraalseid valke ei saa lahustada neutraalsetes vesipuhvrites ega agregaatides..

• Erinevalt perifeersetest valkudest on lahustunud proteiinid seotud lipiididega.

• Perifeersete valkude näideteks on erütrotsüütide spektriin, mitokondrite tsütokroom C ja ATP-ase ning atsetüülkoliini esteraas elektroplaksmembraanides. Integreeritavate valkude näideteks on membraaniga seotud ensüümid, ravimite ja hormoonide retseptorid, antigeen ja rodopsiin.

• Integraalsed valgud moodustavad umbes 70%, perifeersed valgud aga plasmamembraani valkude ülejäänud osa.