Lac vs Trp Operon
Operon on spetsiaalne geenide joondamine prokarüootides. Ühes operonis joondab see kõiki konkreetse funktsiooni jaoks vajalikke geene. See organisatsioon võimaldab ühel promootoril aktiveerida, desaktiveerida ja reguleerida kõiki ühes kindlas funktsioonis osalevaid geene. Selle olemuse tõttu nimetatakse operoni prokarüootse geeni ekspressiooni funktsionaalseks üksuseks. Lac-operon ja Trp-operon on kaks operoni, mida leidub E. coli bakteri genoomis ja paljudes teistes bakterites. Need operonid kontrollivad erinevaid funktsioone. Operon on prokarüootse geeni ekspressiooni funktsionaalne üksus.
Lac Operon
Lac-operon on geenide klaster, mis vastutab laktoosi transpordi ja metabolismi eest E. coli bakterites. Operonil on üks promootorpiirkond ja geenid lac Z, lac Y, lac A ja lac I. Operon aktiveeritakse laktoosi juuresolekul. Lac Z, lac Y, lac A toodavad beeta-galaktosidaasi, laktoosi permeaasi ja tiogalaktosiidi transatsetülaasi ensüüme.
Permeaasi ensüüm võimaldab laktoosil rakku jõuda ja beeta-galaktosidaas hüdrolüüsib laktoosi glükoosiks ja galaktoosiks. Substraatide funktsionaliseerimiseks kasutatakse transatsetülaasi. Kui on olemas eelistatavam substraat või laktoos puudub, aktiveeritakse lac I. Nii saadakse allolaktoosi siduv valk. Allolktoosi juuresolekul seonduvad repressorvalgu molekulid allolaktoosimolekulidega. See võimaldab transkriptsiooni jätkata häirimata. Laktoosi puudumisel seostub see valk lac-operoni blokeeriva ja geeni transkriptsiooni peatava promootorpiirkonnaga (kontrollüksus). Sel juhul ei toodeta laktoosi permeaasi ega beeta-galaktosidaasi. Seetõttu peatatakse laktoosi katabolism.
Trp Operon
Trp-operon on ka geenide klaster, mida kontrollib üks promootor. See operon sisaldab kõiki Trp sünteesiks vajalikke geene. Trüptofaan, mida tavaliselt lühendatakse kui Trp, on ebaharilik aminohape. Operoon koosneb trp E, trp D, trp C, trp B ja trp A, mis ühiselt kodeerivad trüptofaani süntetaasi; ensüüm, mis toodab trüptofaani.
Trp-operon sisaldab ka trp R, mis tekitab vajaduse korral repressori. Trüptofaani juuresolekul deaktiveeritakse see operon, kuna repressor muudab oma kehaehituse aktiivseks vormiks ja on seotud promootoripiirkonnaga. Trüptofaani puudumisel vabaneb repressorvalk promootorpiirkonnast või on inaktiivses konformatsioonis, mis ei saa promootoripiirkonnaga seostuda, ja sel viisil innustatakse geenide transkriptsiooni, tehes trüptofaani. Erinevalt lac-operonist desaktiveeritakse see operon trüptofaani juuresolekul, seda mehhanismi nimetatakse “negatiivse repressiivse tagasiside mehhanism”.
Mis vahe on Lac-operonil ja Trp-operonil??
• Lac-operon osaleb suhkru kataboolses protsessis, kuid Trp-operon osaleb aminohappe anaboolses protsessis.
• Lac-operoon aktiveeritakse laktoosi juuresolekul, Trp-operon deaktiveeritakse trüptofaani juuresolekul.
• Lac-operon koosneb kolmest struktuursest geenist ja repressorgeenist, kuid Trp operon koosneb viiest struktuurigeenist ja repressorgeenist.
• Lac-operon ei kasuta sumbumismehhanismi, kuid Trp-operon kasutab sumbumismehhanismi.