Erinevus metabolismi ja metaboomika vahel

Peamine erinevus - ainevahetus vs metaboolika
 

Metaboliidid on väikesed molekulid, mis osalevad rakkude metaboolsetes reaktsioonides. Metaboliidid hõlmavad metaboolseid vaheprodukte, hormoone, sekundaarseid metaboliite, signaalmolekule jne. Need on rakkude biokeemiliste reaktsioonide toimivad molekulid. Bioloogilise proovi või ühe organismi metaboliitide täielik komplekt on tuntud kui metaboliit. Metabolome on dünaamiline kollektsioon, mis muutub kehas iga sekundiga. Metaboloomika ja metabonoomika on kaks mõistet, mis on seotud organismi metaboliitide uurimisega. Peamine erinevus metaboomika ja metabonoomika vahel on see metaboomika on rohkem mures normaalse endogeense metabolismi pärast ja metaboolne profileerimine raku või elundi tasemel samas ainevahetus on rohkem seotud metaboolse profileerimise laiendamisega keskkonnateguritest, haigustest, soolestiku mikroorganismidest põhjustatud metabolismi häirete kohta ja metaboolsete profiilide võrdlemisest jne.. Metaboloomikat juhib peamiselt massispektromeetria ja metaboloomika kasutab metaboliitide analüüsiks NMR-spektroskoopiat.

SISU
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on ainevahetus
3. Mis on metaboonika
4. Kõrvuti võrdlus - ainevahetus vs metaboolika
5. Kokkuvõte

Mis on ainevahetus?

Metaboloomika on rakkudes, biovedelikes, kudedes või organismides toimuvate metaboolsete protsesside uurimine. See hõlmab rakuliste metaboliitide identifitseerimist ja kvantifitseerimist, kasutades häid analüütilisi ja statistilisi vahendeid. Metabolomikat peetakse oluliseks uuringuks, kuna see annab teavet organismi metabolismi kohta.

Ainevahetusreaktsioonide substraatide ja saaduste uurimiseks kasutab metaboomika analüütilise platvormina massispektromeetriat. Mass-spektromeetria näitab metaboliitide tüüpe ja nende kontsentratsioone, kajastades rakkude või kudede tegelikku biokeemilist seisundit. Seetõttu võib metaboomikat pidada organismi molekulaarse fenotüübi parimaks esindajaks. Ainevahetus on organismide väikeste molekulide omiline tehnoloogia, mida võrreldakse teiste omiliste uuringutega; metaboomika on väga oluline, kuna see peegeldab otseselt rakkude biokeemilise reaktsiooni hetkeseisu.

Metabolomikat võib pidada ka proteoomika laiendamiseks, kuna need tekivad ensüümide aktiivsuse tõttu, mis on valgud, nagu on näidatud järgmisel joonisel.

Joonis 01: Ainevahetuse skeem

Mis on metaboonika?

Metabonoomiat defineeritakse kui multiparameetriliste metaboolsete reaktsioonide kvantitatiivset mõõtmist konkreetsetel aegadel seoses patofüsioloogiliste stresside või geneetilise muundamisega. Seda rakendatakse tavaliselt uuringutes, mis käsitlevad inimeste toitumist ning ravivastust ravimitele või haigustele. Selle lähenemisviisi juhib Jeremy Nicholson Londoni Imperiali kolledžis ja seda on kasutatud paljudes valdkondades, sealhulgas toksikoloogia, haiguste diagnoosimine, toitumine jne. Ajalooliselt oli metabonoomia üks esimesi meetodeid, mille abil süsteemibioloogiat hakati kasutama uuringutes. ainevahetusest.

Metabonoomika on rohkem mures biokeemiliste profiilide võrdlemise kui selle asemel, et tuvastada metabolismis üksikuid metaboolseid ühendeid. Seetõttu võib metabonoomikat määratleda kui metaboomika alamhulka. Peamiselt rõhutatakse erinevate populatsioonide metaboolsete profiilide võrdlemist haiguste, keskkonnastresside, geneetilise muundamise, toitumise, ravimite jms osas, kuna metaboliidid on head markerid, mis annavad märku haigusseisunditest, ravimite mõjust, keskkonnamõjudest, kokkupuutest toksiinidega , jne.

Metabonoomilised uuringud paljastasid nii rakusiseseid kui ka rakuväliseid metaboliite. See kasutab suure läbilaskevõimega tehnikaid suure hulga metaboliitide analüüsimiseks üheaegselt ja korduvalt, võimaldades rakkude füsioloogilise seisundi ajalist uurimist. Samuti selgub seos metaboliitide ja organismi patoloogilise seisundi vahel. Metabonoomiliste uuringute toetamiseks võib kasutada genoomikat ja proteoomikat, kuna need on omavahel seotud, nagu näidatud ülaltoodud joonisel.

Mis vahe on metaboolika ja metaboomika??

Ainevahetus vs metaboomia
Metaboloomika on organismi metaboliitide kogu komplekti uurimine	Metabonoomia on elusate süsteemide multiparameetriliste metaboolsete reageeringute kvantitatiivne uurimine ajaliselt patofüsioloogiliste stiimulite või geneetilise muundamise korral.
Põhimure
Ainevahetus on rohkem seotud metaboolse profiilimise ja rakkudes esinevate üksikute metaboliitide tuvastamisega.	Metabonoomia on seotud pigem populatsioonide metaboliitide või metaboolsete profiilide võrdlusega geneetiliste modifikatsioonide, haiguste, keskkonnastresside, patoloogiliste stiimulite, ravimite jms osas..
Teave
Ainevahetus keskendub peamiselt endogeensele metabolismile.	Metabonoomia ei piirdu endogeense metabolismiga. See laieneb teabe leidmisele ainevahetuse häiretest, mis on põhjustatud sisemistest ja välistest teguritest, näiteks toitumisharjumused, toksiinid, haigusprotsessid jne..
Analüütilised tööriistad
See kasutab peamise analüütilise platvormina mass-spektromeetriat	Metabonoomika kasutab peamise analüütilise platvormina NMR-spektroskoopiat.

Kokkuvõte - ainevahetus vs metaboolika

Metaboloom esindab rakus või organismis esinevate väikeste molekulide, mida nimetatakse metaboliitideks, komplekti. Metaboloomika on kogu metaboomi uurimine metaboolse profiili loomiseks. Metaboloomika võimaldab teadlastel mõõta raku või organismi tegelikku füsioloogilist seisundit. Metabonoomia on osa metaboomikast, mille eesmärk on saada teavet elusate süsteemide multiparameetriliste metaboolsete reageeringute kohta patofüsioloogilistele stiimulitele ja geneetilistele modifikatsioonidele. Metabonoomia ei puuduta ainult individuaalset metaboolset profileerimist, näiteks metaboomikat; selles võrreldakse metaboolseid profiile teiste teguritega, nagu keskkonnastressid, haigused, toksiinid jne. Nii metaboomika kui ka metabonoomika hõlmavad organismide metaboliitide uuringuid rakkude tegeliku füsioloogilise seisundi mõõtmiseks. Seetõttu peetakse neid kahte mõnikord sünonüümideks, arvestamata metaboomika ja metabonoomika erinevust.

Viide:
1. Roessner, Ute ja Jairus Bowne. "Mis on metaboomika?" BioTechniques - mis üldse on metaboomika? N.p., aprill 2009. Veeb. 24. aprill 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). “Metaboloomika ja metaboomika.” Springer. Springer London, 1. jaanuar 1970. Veeb. 25. aprill 2017

Pilt viisakalt:
1. Metaboomika skeem Lmaps (vestlus) - Omatöö (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu