Erinevus motiivi ja domeeni vahel

võtme erinevus motiivi ja domeeni vahel on see, et motiiv ei ole iseseisvalt stabiilne, samas kui domeen on iseseisvalt stabiilne.

Valgud on meie kehas olulised bioloogilised makromolekulid. Teisest küljest otsustab valgu aminohappejärjestuse geeni geneetiline kood. Lisaks on valkudel primaarne, sekundaarne ja tertsiaarne struktuur. Esmane struktuur on polüpeptiidahela aminohappeline järjestus. Kui polüpeptiidahelad omavahel voldivad, moodustab see valgu sekundaarse struktuuri. Alfa-heelikaalid, beeta-lehed ja super-sekundaarsed struktuurid kuuluvad sekundaarstruktuuridesse. Teatud super-sekundaarsete elementide rühmitusi tuntakse proteiinimotiividena. Valgu tertsiaarne struktuur viitab selle kolmemõõtmelisele struktuurile, mis otsustab valgu funktsiooni. Domeen on valgu molekuli volditud osa, mis on ümmargune ja millel on diskreetne funktsioon. See on valgu põhiline funktsionaalne ja kolmemõõtmeline struktuur.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on motiiv
3. Mis on domeen
4. Motiivi ja domeeni sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - motiiv vs domeen tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on motiiv?

Motiiv on valkude super sekundaarsete elementide, näiteks alfaheelikute ja beeta-struktuuride kindel rühmitus. Need on mingid mustrid, mis esinevad erinevates valkudes. Motiivid kirjeldavad sekundaarsete konstruktsioonielementide voltimisharjumusi ja nende vastasmõjusid. Need voltimismustrid stabiliseeruvad sarnaste sidemete abil, mis esinevad kolmanda astme struktuurides. Kuid need pole nii keerulised kui kolmanda astme struktuurid.

Joonis 01: motiiv

Need on lihtsad valkude sekundaarstruktuuride kombinatsioonid. Motiiv pole iseenesest stabiilne. Lisaks selgitavad motiivid valgu struktuuri, kuid ei ennusta valgu funktsiooni. Valgumotiivide näideteks on beeta-alfa-beeta motiiv, Kreeka võtmemotiiv, Beeta tünn, Beeta-meandermotiiv jne..

Mis on domeen?

Domeen on valgu põhiline, funktsionaalne ja kolmemõõtmeline üksus. See täidab teatud funktsiooni. Ühel valgul võib olla mitu erinevat domeeni. Iga domeen on iseseisev üksus. See on globaalne struktuur. See vastutab konkreetse funktsiooni või interaktsiooni eest. Domeene saab kasutada iseloomustamata valgu funktsiooni hüpoteesiks. Valgu analüüsimisel on oluline arvestada, kuna domeenid on valgu funktsionaalsed üksused.

Joonis 02: püruvaadi kinaasi kolm erinevat domeeni

Domeenid on väga stabiilsed ja kompaktsed struktuurid. Neid saab teistest piirkondadest hõlpsalt eristada. Püruvaadi kinaasil on kolm eristatavat domeeni, nagu on näidatud joonisel 02. Domeeni pikkus võib varieeruda ja keskmine pikkus on 100 aminohapet. Iga domeen sisaldab sekundaarsetest struktuuriüksustest ehitatud hüdrofoobset südamikku. Mitmed domeenid koos moodustavad valgu tertsiaarse struktuuri.

Millised on motiivi ja domeeni sarnasused?

• Motiiv ja domeen on ühikud, mis esinevad valgu molekulides endas.
• Need on kasulikud valguperekondade klassifitseerimisel.

Mis vahe on motiivil ja domeenil??

Motiiv on valkude super sekundaarsete elementide, näiteks alfa-heelikate ja beeta-struktuuride kindel rühmitus, samas kui domeen on valgu funktsionaalne üksus. Lisaks on motiivil sekundaarne struktuur, samas kui domeen vastutab valgu tertsiaarse struktuuri eest. Pealegi on domeen erinevalt motiivist iseseisev üksus. Samuti kujutab domeen valgu funktsiooni, motiiv aga mitte. Need on peamised erinevused motiivi ja domeeni vahel. Allpool toodud infograafik näitab motiivi ja domeeni erinevust tabelina.

Kokkuvõte - motiiv vs domeen

Motiiv on valgu molekuli sekundaarstruktuuride paigutus. Erinevalt domeenist pole see iseenesest tavaliselt stabiilne. Domeen on valgu sõltumatult stabiilne struktuur. Seetõttu võib see olla osa või kogu valgu molekul. See on valgu kolmemõõtmeline funktsionaalne üksus. Lisaks on sellel funktsioon ja see on iseseisev üksus. Motiiv võib olla osa domeenist. Kuid domeen ei saa olla motiivi osa. See on erinevus motiivi ja domeeni vahel.

Viide:

1. „Valgu domeen”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31. juuli 2018. Saadaval siin

Pilt viisakalt:

1. “Antraksi toksiini valgu võtmemotiiv” - autor NatelewisDerivatiivne töö (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu
2. “Püruvaadi kinaasi valgu domeenid” - autor Thomas Splettstoesser - Oma töö, (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu