Viirused on väikesed nakkavad osakesed, mis paljunevad ainult elusorganismi sees. Nad on võimelised nakatama peaaegu kõiki elusorganisme, sealhulgas loomi, taimi ja baktereid. Need on mikroskoopilised osakesed, mis koosnevad valgukapsiididest ja DNA või RNA genoomist. Viiruse genoom võib olla kas DNA või RNA, üheahelaline või kaheahelaline, ümmargune või lineaarne. Baltimore'i klassifitseerimissüsteemi kohaselt saab viirused liigitada seitsmesse rühma vastavalt nende genoomi tüübile. Retroviirus ja bakteriofaag on kaks olulist viiruse kategooriat. Peamine erinevus retroviiruse ja bakteriofaagi vahel on see retroviirus on viiruste rühm, mis sisaldab positiivset mõistab üheahelalist RNA genoomi ja on võimeline replitseeruma DNA vaheühendi kaudu samas bakteriofaag on baktereid nakatav viirus, mis sisaldab kas DNA või RNA genoomi.
SISU
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on retroviirus
3. Mis on bakteriofaag
4. Kõrvuti võrdlus - retroviirus vs bakteriofaag
5. Kokkuvõte
Retroviirus on viiruste rühm, millel on positiivse mõttes üheahelaline RNA genoom. Need sisaldavad ensüümi, mida nimetatakse pöördtranskriptaasiks ja nende replikatsioon toimub DNA vaheühendi kaudu. Vahepealse DNA tootmine replikatsiooni ajal on selle viiruste rühma ainulaadne.
Infektsiooni ajal kinnituvad retroviirused peremeesrakuga spetsiifiliste glükoproteiinide kaudu, mis asuvad viiruseosakese välispinnal. Nad sulanduvad rakumembraaniga ja sisenevad peremeesrakku. Pärast peremeesraku tsütoplasmasse tungimist transkribeerib retroviirus pöördtranskriptaasi ensüümi abil oma genoomi kaheahelaliseks DNA-ks. Uus DNA integreerub peremeesraku genoomi, kasutades ensüümi, mida nimetatakse integraasiks. Kuigi nakkus toimub, ei suuda peremeesrakk pärast integreerimist viiruse DNA-d ära tunda. Seega reprodutseerib peremeesgenoomi replikatsiooni ajal viiruse genoom ja toodab vajalikke valke viiruseosakeste uute koopiate tegemiseks.
Inimese immuunpuudulikkuse viirus (HIV) ja inimese T-rakulise leukeemia viirus (HTLV) on tavalised inimese retroviirused. HIV põhjustab haiguse AID-sid ja HTLV põhjustab leukeemiat.
Tänu retroviiruste loomulikule võimele sisestada peremeesorganismidesse viiruse genoomi, kasutatakse geenide kohaletoimetamise süsteemides retroviiruseid ja neid peetakse molekulaarbioloogia väärtuslikeks uurimisvahenditeks.
Joonis 01: HIV replikatsioon
Bakteriofaag (faag) on viirus, mis nakatab ja levib konkreetses bakteris. Neid tuntakse ka bakterisööjatena, kuna need toimivad bakteritsiidsete ainetena. Bakteriofaagid avastas Frederick W. Twort 1915. aastal ja Felix d'Herelle nimetas need 1917. aastal bakteriofaagideks. Need on kõige rikkalikumad viirused maakeral. Need koosnevad ka genoomist ja valgu kapsiidist. Bakteriofaagi genoom võib olla kas DNA või RNA. Kuid suurem osa bakteriofaagidest on kaheahelalised DNA viirused.
Bakteriofaagid on spetsiifilised ühele bakterile või konkreetsele bakterirühmale. Neid nimetatakse koos bakteritüve või liikidega, mida nad nakatavad. Näiteks bakteriofaagid, mis nakatavad E coli nimetatakse kolifaagideks. Bakteriofaagides on erinevaid kujundeid. Kõige tavalisem bakteriofaagide kuju on pea ja saba kuju.
Bakteriofaagid peaksid paljunema peremeesrakus. Nad kinnituvad pinnaretseptorite abil tihedalt bakteriraku seina külge ja süstivad oma geneetilise materjali peremeesrakku. Bakteriofaagid võivad läbida kahte tüüpi nakkust, mida nimetatakse lüütiliseks ja lüsogeenseks tsükliks. See sõltub faagi tüübist. Lüütilises tsüklis nakatavad bakteriofaagid baktereid ja tapavad kiirelt peremeesbakteri raku lüüsi teel. Lüsogeense tsükli käigus integreerub viiruse geneetiline materjal bakteri genoomi või plasmiididega ja eksisteerib peremeesrakus mitu kuni tuhat põlvkonda ilma peremeesbakterit tapmata.
Faagidel on molekulaarbioloogias mitmesuguseid rakendusi. Neid kasutatakse patogeensete bakteritüvede raviks, mis on resistentsed antibiootikumide suhtes. Neid saab kasutada ka haiguste diagnoosimisel spetsiifiliste bakterite tuvastamiseks.
Joonis 02: bakteriofaagnakkus
Retroviirus vs bakteriofaag | |
Retroviirus on viiruste rühm, mis sisaldab üheahelalist RNA genoomi. | Bakteriofaag on viirus, mis nakatab ja paljuneb bakterites. |
Pöördtranskriptaasi olemasolu | |
Retroviirus sisaldab ensüümi, mida nimetatakse pöördtranskriptaasiks. | Bakteriofaag ei sisalda pöördtranskriptaasi. |
Pöördtranskriptsiooni esinemine | |
Pöördtranskriptsioon toimub viiruse replikatsiooni ajal | Pöördtranskriptsiooni viiruse replikatsiooni ajal ei toimu. |
DNA vaheühendi tootmine | |
Retroviirused toodavad genoomi vahepealse DNA koopia. | Bakteriofaag ei tekita DNA vaheühendit. |
Retroviirus ja bakteriofaag on kahte tüüpi viirused. Retroviirus on positiivsete sensside üheahelalise RNA genoomiga viiruste rühm, mis replitseerub vahepealse DNA kaudu. Bakteriofaag on viirus, mis ründab baktereid ja paljuneb, kasutades bakterite replikatsioonimehhanisme. Bakteriofaagid on biosfääri kõige arvukamad viirused ja neil võib olla kas DNA või RNA genoom. See on erinevus retroviiruse ja bakteriofaagi vahel.
Viited:
1. Coffin, John M. “Retroviiruste koht bioloogias”. Retroviirused. USA Rahvusraamatukogu, 1. jaanuar 1997. Veeb. 05. aprill 2017
2. Gelderblom, Hans R. “Viiruste struktuur ja klassifikatsioon.” Meditsiiniline mikrobioloogia. 4. väljaanne. USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, 1. jaanuar 1996. Veeb. 05. aprill 2017
3. Hatfull, Graham F. ja Roger W. Hendrix. "Bakteriofaagid ja nende genoomid." Praegune arvamus viroloogias. USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, 1. oktoober 2011. Veeb. 05. aprill 2017
4. Coffin, John M. “Immuunvastus retroviirusnakkusele.” Retroviirused. USA Rahvusraamatukogu, 1. jaanuar 1997. Veeb. 05. aprill 2017
Pilt viisakalt:
“Hiv bruto” Tõlkinud Raul654 - Algselt GFDL-i pildilt Pilt: Hiv gross german.png, (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia kaudu
„Faag süstib oma genoomi bakterirakku“ - GrahamColm inglise Vikipeedias (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia kaudu