võtme erinevus Rho sõltuva ja Rho sõltumatu lõpetamise vahel on see, et Rho-sõltuv terminatsioon, Rho-faktor seob transkripti ja lõpetab transkriptsiooni, purustades vesiniksidemed matriitsi ja transkripti vahel, samas kui Rho-iseseisev terminatsioon lõpetab transkriptsiooni, tekitades juuksenõelaga struktuuri ja seejärel U-rikka piirkonna transkriptsioonis.
Transkriptsioon on üks kahest geeniekspressiooni etapist. See on protsess, mille käigus genereeritakse geeni DNA-järjestuses peidetud geneetilisest informatsioonist mRNA järjestus. Transkriptsioon toimub kolme etapi kaudu: initsieerimine, pikendamine ja lõpetamine. RNA polümeraasi ensüüm seostub geeni promootorjärjestusega ja alustab RNA ahela sünteesi katalüüsimist. Kuni terminaatorjärjestuse leidmiseni lisab RNA polümeraas nukleotiide ja ehitab RNA ahela. Prokarüootides toimub lõpetamine kahe peamise lõpetamisstrateegia kaudu: Rho-sõltuv lõpetamine ja Rho-st sõltumatu lõpetamine. Rho faktor on valk, millel on helikaasi aktiivsus.
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on Rho-st sõltuv lõpetamine
3. Mis on Rho iseseisev lõpetamine
4. Sarnasused Rho-sõltuva ja Rho-sõltumatu lõpetamise vahel
5. Kõrvuti võrdlus - Rho sõltuv vs Rho sõltumatu lõpetamine tabelina
6. Kokkuvõte
Rho-sõltuv terminatsioon on üks kahest transkriptsiooni terminatsiooni strateegiast, mis esinevad prokarüootides. Rho faktor on valk, millel on helikaasi aktiivsus.
Joonis 01: Rho-sõltuv lõpetamine
Rho valk seob RNA transkripti ja liigub mööda RNA polümeraasi 5'-3 'suunas, soodustades vesiniksidemete dissotsieerumist DNA matriitsi ja RNA transkriptsiooni vahel. Kui Rho faktor jõuab transkriptsioonimullini, tõmbab see DNA / RNA hübriidi lahku ja vabastab transkriptsiooni mullist transkripti. Kui see juhtub, lõpetab see transkriptsiooni.
Rho iseseisev terminatsioon on teine strateegia, mis lõpetab prokarüootilise transkriptsiooni. Tavaliselt on terminaatori piirkonnas ümberpööratud kordusjada. Vahetult pärast ümberpööratud kordusjärjestust on adeniinirikas piirkond (AAAA). Kui RNA polümeraas liigub edasi, tekitab see mRNA järjestuse. Kuna need kaks piirkonda on üksteise ümberpööratud korduvas järjestuses komplementaarsed, moodustab see vesiniksideme tõttu juuksenõela silmuse struktuuri. Järgmine piirkond on U-rikas piirkond. Juuksenõela struktuur lõpetab RNA polümeraasi aktiivsuse.
Joonis 02: Rho sõltumatu lõpetamine
Pealegi on U-rikastes piirkondades madal interaktsioon transkriptsiooni U-aluste ja A-aluste vahel nõrk. Need nõrgad adeniini-uratsiili sidemed destabiliseerivad DNA matriitsi ja RNA transkripti ning eraldavad teineteist. Lõpuks vabaneb transkriptsioon transkriptsioonikohast.
Rho-st sõltuvat terminatsiooni vahendab Rho valk, samas kui Rho-st sõltumatu terminatsioon toimub juuksenõela silmuse struktuuri moodustamise kaudu. Niisiis, see on peamine erinevus Rho sõltuva ja Rho iseseisva lõpetamise vahel. Lisaks kasutab Rho valk ATP energiat, samas kui Rho sõltumatu terminatsioon ei hõlma Rho valku ega kasuta ATP energiat. Seetõttu on see ka oluline erinevus Rho-sõltuva ja Rho-sõltumatu terminatsiooni vahel.
Allpool toodud infograafik näitab rohkem võrdlusi, mis on seotud Rho-sõltuva ja Rho-sõltumatu terminatsiooni erinevusega.
Rho-sõltuv ja Rho-iseseisev terminatsioon on kaks peamist transkriptsiooni terminatsiooni mehhanismi, mis esinevad prokarüootides. Rho valk vastutab transkriptsiooni terminatsiooni eest Rho-sõltuval terminatsioonil. Seevastu Rho iseseisev lõpetamine toimub juuksenõela silmuse struktuuri moodustumise kaudu. Niisiis, see on peamine erinevus Rho sõltuva ja Rho iseseisva lõpetamise vahel.
1. „Transkriptsiooni etapid”. Khani Akadeemia, saadaval siit.
2. „Tegelik lõpetamine”. Vikipeedia, Wikimedia Foundation, 8. veebruar 2019, saadaval siin.
1. “Rho-sõltuv terminaator”, autor Oalnafo1 - Oma töö (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu
2. “Rho-sõltumatu terminaator” - autor Ppgardne inglise Vikipeedias (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia kaudu