Erinevus siRNA ja miRNA vahel

siRNA vs miRNA

RNA-d on väga olulised molekulid, mis aitavad üles ehitada organismide elu. Hiljuti on teadlased avastanud väikesed RNA-d, mida nimetatakse RNA sekkumine või RNAi, mis toimivad pärast transkriptsiooni, et kontrollida geeni ekspressiooni. Kaks peamist tüüpi väikest RNA-d on mikro-RNA või miRNA ja väike segav RNA või siRNA. Need molekulid reguleerivad põhimõtteliselt geeni ekspressiooni, surudes alla sihtgeeni. Nii miRNA kui ka siRNA biogeneesi rada on väga sarnane, kuigi nende vahel on mõned erinevused. MiRNA ja siRNA päritolu on pärit dsRNA molekulidest. Küpsed miRNA-d on struktuurilt sarnased siRNA molekulidega.

miRNA

Mikro-RNA-d või miRNA-d on väikesed RNA-molekulid, mis vahendavad translatsioonilise geeni regulatsiooni lõppkontrolli. MiRNA dereguleerimine võib põhjustada vähktõbe ja muid haigusi. Seetõttu on miRNA mittekodeeritavas piirkonnas kodeeritud teabe õige reguleerimine paljudes rakuprotsessides väga kriitiline.

siRNA

siRNA-sid nimetatakse ka lühike segav või vaigistav RNA ja koosnevad kaheahelalisest RNA-st, millel on 20 kuni 25 aluspaari. SiRNA peamine roll on segada komplementaarsete nukleotiidijärjestustega spetsiifiliste geenide ekspressiooni. siRNA koosneb lühikesest kaheahelalisest RNA-st, millel on fosforüülitud 5 'otsad ja hüdroksüülitud 3' otsad, millel on kaks üleulatuvat nukleotiidi.

Mis vahe on siRNA ja miRNA vahel??

• miRNA, mis on saadud spetsiifilistest genoomsetest lookustest, siRNA aga mRNA, transposoonide, viiruste või heterokromaatilise DNA korral.

• miRNA sünteesi töödeldakse pikematest juuksenõelte prekursor-transkriptidest (primaarne tuuma miRNA järjestus RNase III endonukleaasi abil), samas kui pikkadest bimolekulaarsetest RNA dupleksidest töödeldud siRNA-ga.

• Iga miRNA juuksenõela eelühendi molekul tekitab ühe miRNA dupleksi, samas kui iga siRNA eelühendi molekul tekitab mitu siRNA dupleksi.

• siRNA järjestused on harva konserveerunud, samas kui miRNA järjestused on hästi konserveerunud.

• Kõik siRNA-s olevad alused aitavad kaasa selle siht-spetsiifilisusele, samas kui ainult 5 'pool miRNA-st aitab kaasa selle siht-spetsiifilisusele.

• miRNA seostub sageli sihttranskriptide 3 'transleerimata piirkonnaga, samas kui siRNA-d moodustavad komplementaarse dupleksi ükskõik kus mööda sihtmärgi mRNA-d.

• miRNA täpsustab 'heterosummutamist', siRNA aga 'automaatset summutamist'.

• miRNA toimib signaalina translatsiooni takistamiseks, siRNA aga füüsiliselt takistab translatsiooni.