Erinevus sihtotstarbelise ja sihipärase proteoomika vahel

Peamine erinevus sihitud ja sihitu proteoomika vahel on see, et sihitud proteoomika eesmärk on mõõta konkreetse valgu arvukust, samal ajal kui sihtimata proteoomika ei sihi konkreetset valku.

Proteoomika on valkude, nende struktuuride ja funktsioonide suuremahuline uurimine. See uurib spetsiifilistes tingimustes raku, koe või organismi tervet valgukomplementi. On kahte tüüpi proteoomikat kui sihtotstarbelist proteoomikat ja sihtimata proteoomikat.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on suunatud proteoomika
3. Mis on sihtimata proteoomika
4. Sarnasused sihitud ja sihtrühmata proteoomika vahel
5. Kõrvuti võrdlus - sihitud vs sihtimata proteoomika tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on suunatud proteoomika?

Nagu nimetus näitab, on suunatud proteoomika suunatud analüüsimiseks spetsiifilisele valgule või peptiidile valkude keerulises segus. Seejärel analüüsib ta selle eelnevalt valitud konkreetse valgu olemasolu ja kogust. See meetod on võimalik ainult ühe proovi või mitme proovi puhul. See meetod sobib isegi kindla valkude rühma jaoks. Selle tulemuseks on täpsemad, kvantitatiivsed ja tundlikud andmed. Lisaks annab massispektromeetria koos sihitud proteoomikaga täpsemad usaldusväärsed mõõtmised. Selle meetodi jaoks kasutatakse analüüsimiseks kolmekordse kvadrupooli massispektromeetrit (QQQ).

Joonis 01: Proteoomika

Sihtotstarbeline proteoomika on sobiv meetod, kui soovite kontrollida, kas löögi sihtmärk on tegelikult maha löödud või kui soovite kvantifitseerida konkreetset valku / peptiidi vere seerumis, ajuvedelikus või rakulüsaadis jne. Võite seda kasutada ka siis, kui soovite et kontrollida, kas konkreetne valk ekspresseerub proovides või ajakatse jooksul diferentseeritult.

Mis on sihtrühmata proteoomika?

Nagu nimest mainitud, ei ole sihtrühma mittekuuluvad proteoomikad selle analüüsimiseks suunatud kindlale valgule või peptiidile. Avastusproteoomika on sihtrühmata proteoomika teine ​​nimi. Tegelikult on tegemist globaalsema analüüsiga. Üldiselt on sihtimata proteoomika teostamine vastus küsimusele “mis valku või valke selles proovis või mitmes proovis on?”. See meetod ei ole tundlik kui suunatud proteoomika. Kuid see suudab tuvastada ja mõõta paljusid valke, sealhulgas uudseid valke. Sihtimata proteoomika võib anda nii kvantitatiivseid kui ka kvalitatiivseid mõõtmisi.

Millised on sarnasused sihitud ja sihtrühmata proteoomika vahel?

• Nii suunatud kui ka sihitu proteoomika mõõdavad valke proovides.
• Need on olulised proteoomianalüüsis.
• Nendes meetodites kasutatakse massispektromeetriat.

Mis vahe on sihtotstarbelisel ja sihipärasel proteoomikal??

Esiteks on suunatud proteoomika konkreetse valgu või peptiidi olemasolu ja koguse määramine valkude komplekssegus. Seevastu on sihtimata proteoomika proovis või proovides leiduvate valkude kvantitatiivne ja kvalitatiivne uuring ilma konkreetset valku suunamata. Selle proovi valkude tüüpide väljaselgitamiseks viiakse sihitud proteoomika läbi eelvalitud või sihtrühma kuuluvate valkudega, samal ajal kui sihtrühma mittekuuluva proteoomikaga. Lisaks on suunatud proteoomika tundlikum kui sihtimata proteoomika.

Kokkuvõte - sihitud vs sihtimata proteoomika

Kokkuvõtteks võib öelda, et sihipärane ja sihitu proteoomika on kahte tüüpi valguuuringud. Nagu nende nimed viitavad, sihitud proteoomika on suunatud kindlale valgule, samal ajal kui sihtimata proteoomika ei sihi konkreetset valku. See on erinevus sihitud ja sihitu proteoomika vahel.

Viide:

1. „Sihitud proteoomika”. UC Davis Proteomics Core, saadaval siit.
2. “Proteoomika / sissejuhatus proteomikasse.” Muusikateooria / režiimid - Wikibooks, avatud raamatud avatud maailma jaoks, saadaval siin.

Pilt viisakalt:

1. „Proteomics” Xxl7441 poolt inglise keeles Wikibooks - Üle viidud saidilt en.wikibooks Commonsi (Avalik domeen) Commonsi Wikimedia kaudu