Erinevus YAC ja BAC vektorite vahel

Peamine erinevus - YAC vs BAC vektorid
 

Vektoreid kasutatakse molekulaarses kloonimises. Vektorit võib määratleda kui DNA molekuli, mis käitub kandjana võõra geneetilise materjali viimisel teise rakusse. Võõr-DNA-d sisaldavat vektorit nimetatakse rekombinantseks DNA-ks ja see peaks olema võimeline seda peremeesorganismis replitseerima ja ekspresseerima.. Pärmi kunstlik kromosoom (YAC) ja bakteriaalne kunstlik kromosoom (BAC) on kahte tüüpi kloonimisel osalevaid vektoreid. Peamine erinevus YAC ja BAC vahel on see YAC on kunstlikult konstrueeritud vektorisüsteem, mis kasutab pärmi kromosoomi konkreetset piirkonda, et sisestada pärmirakkudesse suuri geneetiliste materjalide segmente samas BAC on kunstlikult konstrueeritud vektorisüsteem, mis kasutab konkreetset piirkonda E. coli kromosoom suurte DNA segmentide sisestamiseks E. coli rakud.

SISU
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on YAC vektorid?
3. Mis on BAC vektorid?
4. Kõrvuti võrdlus - YAC vs BAC vektorid
5. Kokkuvõte

Mis on YAC vektorid??

YAC (pärmi kunstlik kromosoom) on kunstlikult ehitatud kromosoom, millel on võime kanda suurt osa võõrast DNA-st ja replitseeruda pärmirakkudes. Sellel on nii tsentromeer, telomeerid kui ka autonoomselt replitseeruvad järjestused, mis on replikatsiooniks ja stabiilsuseks hädavajalikud. YAC peaks kandma ka selektiivset markerit või markereid ja restriktsioonisaite, et muuta see efektiivseks kloonimisvektoriks. YAC-sse võib sisestada suure järjestuse vahemikus 1000 kb kuni 2000 kb ja viia pärmi. YAC-i muundamise efektiivsus on väga madal.

Joonis 01: YAC vektor

Mis on BAC vektorid??

Bakteriaalne kunstlik kromosoom (BAC) on kunstlikult konstrueeritud kromosoom molekulaarseks kloonimiseks. Sellel on konkreetsed piirkonnad E. coli F-plasmiid ja see on ümmargune ja supermähitud. BAC on välja töötatud DNA fragmentide kloonimiseks bakteritesse, eriti bakteritesse E. coli. See võib kanda DNA fragmente suurusega kuni 300 kb. Võrreldes YAC-iga on BAC kloonimisdetailid suurusjärgus väiksemad. BAC-id töötati välja 1992. aastal ja see on endiselt populaarne oma stabiilsuse ja ehituse lihtsuse tõttu. BAC-id on kasulikud ka vaktsiinide väljatöötamisel.

Joonis 02: BAC vektor molekulaarses kloonimises

Mis vahe on YAC- ja BAC-vektoritel??

YAC vs BAC vektorid
YAC on geneetiliselt muundatud kromosoom, mille kloonimisel kasutatakse pärmi DNA-d.	BAC on geneetiliselt muundatud DNA molekul, mis kasutab E. coli DNA kloonimiseks.
Sugu
YAC-id olid kavandatud genoomse DNA suurte fragmentide kloonimiseks pärmi.	BAC-id töötati välja suurte genoomsete fragmentide kloonimiseks Escherichia coli.
Sisesta pikkus
YAC-id võivad sisaldada megabaasi suuruseid genoomseid inserte (1000 kb - 2000 kb).	BAC-id võivad kanda inserte, mille suurus on 200-300 kb või vähem.
Ehitus
YAC DNA-d on puutumatuna raske puhastada ja YAC vektorisüsteemi genereerimiseks on vaja suurt kontsentratsiooni.	BAC-i on tervena puhastada lihtne ja seda saab hõlpsasti konstrueerida.
Kimäärlus
YAC on sageli kimäärne.	BAC on harva kimäärne.
Stabiilsus
YAC on ebastabiilne.	BAC on stabiilne.
Modifikatsioonid
Pärmi rekombinatsioon on väga teostatav ja jääb alati aktiivseks. Seega võib see YAC-is tekitada kustutusi ja muid ümberkorraldusi.	E. coli rekombinatsioon on välistatud ja lülitatakse vajadusel sisse. Seega vähendab see BAC-i soovimatuid ümberkorraldusi.
Hooldus
Rekombinantsete YAC-dega manipuleerimine nõuab tavaliselt YAC-i ülekandmist E. coli järgnevaks manipuleerimiseks. Seega on see töömahukas protsess.	BAC muutmine toimub otse E. coli. Nii et DNA ülekandmiseks pole vaja. Seega pole protsess töömahukas.

Kokkuvõte - YAC vs BAC vektorid

YAC on muutunud oluliseks uurimisvahendiks kloonimisprotsessides tänu oma võimele kloonida suuri DNA fragmente peremeesorganismi. Kuid YAC-del on vektoritel mitmeid puudusi, näiteks ehitusraskused, kimäär, ebastabiilsus jne. Seetõttu on teadlased nende probleemide ületamiseks välja töötanud BAC-vektorid. BAC on konstrueeritud kasutades konkreetseid piirkondi E. coli kromosoom. See on stabiilne vektor ja seda saab hõlpsasti konstrueerida. DNA pikkus, millega BAC hakkama saab, on aga kuni 20 korda lühem kui YAC-l. See on erinevus YAC ja BAC vektorisüsteemide vahel. Tänapäeval eelistatakse laborites BAC-i võrreldes YAC-iga.

Viited
1. Shero, J. H., M. K. McCormick, S. E. Antonarakis ja P. Hieter. "Pärmi kunstlikud kromosoomivektorid kloonide tõhusaks manipuleerimiseks ja kaardistamiseks." Genoomika.U.S. Riiklik meditsiiniraamatukogu, juuni 1991. Veeb. 25. märts 2017
2. Ramsay, M. “Pärmi kunstlik kromosoomi kloonimine.” Molekulaarne biotehnoloogia. USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, aprill 1994. Veeb. 25. märts 2017

Pilt viisakalt:
1. Tinastella - BAC kloonimisvektorid Chem114A - (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia kaudu