Differkinome

Erinevus täiustaja ja elluviija vahel

Bioloogia
Share

Mis on täiustaja?

Enhancer määratlus:

Võimendaja on DNA tükk või järjestus, mis suurendab või kiirendab geneetilise transkriptsiooni kiirust. Võimendajat nimetatakse sageli ka cis-regulatoorseks elemendiks ja selle suurus on vahemikus 20 kuni 400 aluspaari DNA.

Asukoht:

Võimendaja võib paikneda kas konkreetsest geenist üles- või allavoolu ning see võib olla transkripteeritava geeniga võrreldes ühesuguses või erinevas orientatsioonis. Enhancer ei pea toimimiseks toimima transkriptsiooni initsiatsioonikoha lähedal. Enhancerid esinevad ja funktsioneerivad nii prokarüootsetes kui ka eukarüootsetes rakkudes. Võimendajaid võib leida intronitest ja eksonitest ning need võivad toimida erineva kromosoomi geenides.

Funktsioon:

Võimendiga kinnitatakse transkriptsioonifaktor, mis aitab stimuleerida geeni transkriptsiooni. Võimendajad ei mõjuta tegelikult otseselt promootoreid, vaid tuleb kõigepealt siduda transkriptsioonifaktoritega. Võimendajad võivad transkriptsiooni initsiatsioonikohas olla tuhandete aluste kaugusel. See on võimalik tänu võimendite toimimisele. Transkriptsioonifaktorid seostuvad kõigepealt võimendusega. Seejärel lähendab DNA painduv valk võimendaja promootorile protsessis, mida tuntakse DNA silmusena. Enhancerid suurendavad või kiirendavad seega transkriptsiooni kiirust, viies transkriptsioonis osalejad promootorile lähemale. Võimendajad võivad reguleerida ka mitut geeni, sõltumata nende orientatsioonist geenide või geenide suhtes. Võimendajad on ka oluline arengu geneetiline element, kuna need võivad aidata rakkudes transkriptsiooni aktiveerimist soodustada.

Tähtsus:

Teatud tugevdajad võivad mängida rolli inimese haigustes ja uuringute põhjal võivad cis-regulaatorid tõepoolest suurendada selliste haiguste riski nagu II tüüpi diabeet, südame-veresoonkonna haigused ja kolorektaalne vähk.

Täiustaja näited:

Avastatud geenivõimenduse näide on HACNS1, millel arvatakse olevat olnud roll inimese pöidla evolutsioonis. Teine tugevdaja näide on proksimaalne epiblasti tugevdaja (PEE), mis on oluline tugevdaja selgroogse keha arengu ajal.

Mis on promootor?

Korraldaja määratlus:

Promootorid on DNA järjestuste tükid, mis näitavad, kust algab DNA transkriptsioon RNA polümeraasi poolt. Promootorid osalevad geneetilise transkriptsiooni algatamises või alustamises, kuna nad määravad, millist DNA ahelat transkribeeritakse (st milline ahel on senss ahel) ja millises suunas transkriptsioon toimub.

Asukoht:

Promootorid leitakse tavaliselt transkriptsiooni algusest ülesvoolu 5'-kohal, kus transkriptsioon algab. Promootorid peavad olema transkribeeritava geeni läheduses 5'-positsioonis. DNA 5'-ots viitab DNA ahelale, mis lõpeb 5'-süsinikul. Promootoreid leidub nii prokarüootsetes kui ka eukarüootsetes rakkudes.

Funktsioon:

Promootorid seostuvad nii RNA polümeraasi ensüümi kui ka transkriptsioonifaktoritega. Promootor algatab transkriptsiooni protsessi, interakteerudes RNA polümeraasi ja transkriptsioonifaktoritega. RNA polümeraasi ensüüm seob nõrgalt DNA järjestust ja liigub mööda ahelat, kuni see kohtub promootoriga. Selles etapis moodustab see siis promootoriga suletud promootorikompleksi. Seejärel toimub RNA polümeraasi DNA lahtirullimine transkriptsiooni initsiatsiooni- või alguskohas, et moodustada avatud promootorikompleks. Seejärel alustatakse transkriptsiooni.

Tähtsus:

Teatud geneetilised promootorid võivad olla seotud haigustega. Promootorite variatsioonid võivad olla seotud teatud haigustega, nagu beeta-talasseemia ja astma.

Näitajad:

Paljudel eukarüootsetel rakkudel on oluline osa promootorist, mida tuntakse TATA kasti nime all, mida võib leida 25 kuni 35 alusest ülespoole transkriptsiooni lähtepunktist. Avastatud on mitmeid näiteid. Mõned neist on olulised vähi tekkes. Näiteks PEG-3 promootor ja inimese telomeraasi pöördtranskriptaas (hTERT), mida mõlemad leidub vähirakkudes.

Erinevus täiustaja ja elluviija vahel?

  1. Definitsioon

Võimendaja on tükk DNA-d, mis võimendab geeni transkriptsiooni. Promootor on DNA tükk, mis käivitab või alustab geeni transkriptsiooni.

  1. Seob

Võimendaja seostub transkriptsioonifaktoritega, promootor seostub transkriptsioonifaktorite ja RNA polümeraasi ensüümiga..

  1. Asukoht

Parandaja võib olla üles- või allavoolu saitist, kus transkriptsioon on algatatud, promootor on alati ülespoole saiti, kus transkriptsioon on algatatud.

  1. Kaugus

Parandaja ei pea olema transkriptsiooni alustamise koha lähedal, promootor peab aga olema transkriptsiooni alustamise saidi lähedal.

  1. Funktsioon

Parandaja töötab transkriptsiooni parendamiseks või suurendamiseks, promootor aga transkriptsiooni käivitamiseks.

  1. Tähtsus

Arvatakse, et tugevdajad on seotud selliste haigustega nagu II tüüpi diabeet, südame-veresoonkonna haigused ja kolorektaalne vähk. Arvatakse, et promootorid on seotud selliste haigustega nagu astma ja beeta-talasseemia

  1. Näited

Parandajate näideteks on HACNS1 ja PEE. Promootorite näideteks on PEG-3 promootor ja inimese telomeraasi pöördtranskriptaas (hTERT)..

Enhancerit ja promootorit võrdlev tabel

Enhancer Vs kokkuvõte Korraldaja

  • Võimendaja on DNA järjestus, mis täiustab transkriptsiooni.
  • Promootor on DNA järjestus, mis käivitab transkriptsiooni.
  • Promootor peab olema transkribeeritava geeni lähedal, samas kui võimendaja ei pea olema huvipakkuva geeni lähedal.
  • Mõlemad promootorid ja võimendajad aitavad reguleerida geneetilist transkriptsiooni.
  • Võimendajad ja promootorid võivad olla haiguse puhul olulised.
Bioloogia
×