Bakterid ja viirused sisenevad inimese kehasse ja paljunevad, põhjustades haigusi. Ehkki nii bakteriaalsed kui ka viirusnakkused esinevad erinevalt mõjutatud elundist, on peamine erinevus viirusliku ja bakteriaalse infektsiooni vahel on see, et bakteriaalsed infektsioonid suurendavad neutrofiilide ja eosinofiilide arvu, viirused suurendavad lümfotsüütide arvu. Meningiit iseloomustab palavik, peavalu, fotofoobia, kaela jäikus ja segasus. Sinusiit esitleb näovalu, palavikku, nohu, ummistunud nina, ninajärgset tilgutamist ja flegmat. Kopsupõletik iseloomustab köha, röga tootmine, valu rinnus ja palavik. Kuseteede infektsioonid esinevad palavik, alakõhuvalu, verega värvunud uriin ja valulik urineerimine.
Kui bakter või viirus siseneb kehasse, puutub see kokku keha kaitsemehhanismidega. See kohtub valged verelibled, makrofaagid, ja dendriitiline rakud, mis seda neelavad ja seedivad. Need bakterid ja viirused sisaldavad molekule, mida kehas keeruline retseptori süsteem identifitseerib võõrkehadena. See käivitab keeruka reaktsioonide seeria, mille eesmärk on võõraste ainete hävitamine. Kui paar esimest bakterit on seeditud, kinnituvad nende võõrvalgud nende lagundatud rakkude rakumembraanile. Need valgud käivitavad B- ja T-lümfotsüüdid. B-lümfotsüüdid moodustavad antikehi ja T-lümfotsüüdid moodustavad toksilisi aineid, mis on mõeldud sissetungijate hävitamiseks. Komplementaarsüsteem aktiveerub ja see moodustab ka membraani, mis seostub bakteriraku membraaniga, mis viib selle hävitamiseni. Kui rakud on kahjustatud kaitserakkude eralduvate mürgiste ainete tõttu, äge põletik käivitub. Kui organism on virulentne, toimub suur reaktsioon. Kui organism on püsiv, mädanik võib tekkida ja krooniline põletik. Kui reaktsioon eemaldab organismi või narkomaaniaravi häirib haiguse loomulikku kulgu, järgneb paranemine lahustumise või armistumisega.
Bakterid on üherakulised organismid. Neil on a rakumembraan, organellid, ja a tuum. Nad tarbivad substraate ja hapnikku ning toodavad energiat. Need paljunevad paljunemiseks. Need võivad olla kommentaarsed, mis elavad harmoonias ilma mingeid sümptomeid tekitamata, ja patogeenid mis põhjustavad haigusi. Kommensaalide hulgas on organisme, mis võimaluse korral haigusi põhjustavad. Neid nimetatakse oportunistlikeks patogeenideks.
Bakteriaalsete infektsioonide esinemine vastavalt nakkuse raskusastmele. Bakteriaalse infektsiooni tagajärjel vabanevad spetsiifilised põletikuvahendajad. Rakuvälised bakterid käivitavad neutrofiilid. Seega näitab täielik vereanalüüs suurt arvu neutrofiile. Rakusisesed bakterid vallandavad nii eosinofiile kui ka neutrofiile ja seetõttu näitab täisvere arv nende rakkude suurenenud arvu. Punaste vereliblede arv võib olla suhteliselt madal. Mõned bakteriaalsed haigused põhjustavad aneemiat. Trombotsüüt arv jääb enamikul juhtudel normaalseks.
Viirused on mikroskoopilised eluvormid, mille a nukleiinhape ahela, valk tuum ja kapsel. Need on lihtsad organismid, mille edukaks ja paljunemiseks on vaja rakku. Seal on RNA viirused ja DNA viirused. DNA viirused liidavad selle DNA otse rakulises replikatsioonisüsteemis ja teevad sellest ise koopiaid. RNA-viirused tekitavad selle RNA-st pöördtranskriptsiooniga ühilduva DNA ahela ja liidavad selle raku mehhanismides selle koopiate saamiseks. (Loe DNA replikatsiooni ja transkriptsiooni erinevus)
Kui viirused sisenevad rakkudesse, lagundatakse osa sellest ja võõrad valgud kinnituvad peremeesrakkude rakumembraanile. See käivitab keha reaktsioonid viiruste vastu. Lümfotsüüdid ülekaalus reaktsioonis viirustega. Mõned viirused pärsivad luuüdi funktsiooni ja piiravad rakkude moodustumist. Seetõttu võivad viirusinfektsioonide korral langeda valgeliblede, trombotsüütide ja punaste vereliblede arv. Mõned viirused suurendavad veresoonte läbilaskvust ja põhjustavad vedeliku lekkimist.
Bakterid on üherakulised organismid, samas kui viirused on primitiivsemad.
Bakteriaalsed infektsioonid suurendavad neutrofiilide ja eosinofiilide arvu, viirused suurendavad lümfotsüütide arvu.