Erinevus VNTR ja sondi vahel

võtme erinevus VNTRi ja sondi vahel on see VNTR on lühike nukleotiidijärjestus, mis toimub genoomis tandemikordusena, samal ajal kui sond on kunstlikult sünteesitud DNA või RNA lühike järjestus, mida saab radioaktiivselt märgistada.

VNTR tähistab muutuva arvu tandem-kordust. See on lühike nukleotiidijärjestus, mis on korraldatud genoomis paralleelselt. VNTR-id esinevad meie genoomis looduslikult. Sond on kunstlikult sünteesitud lühike DNA või RNA järjestus. Mõlemad sond ja VNTR on nukleiinhapped või lühikesed nukleotiidjärjestused. Neid on tohutult kasutatud erinevates molekulaarbioloogilistes tehnikates, peamiselt kohtuekspertiisi uuringutes. VNTR ja sond on sarnased, aga ka erinevad. Seetõttu üritatakse artiklis esile tuua erinevust VNTRi ja sondi vahel.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on VNTR
3. Mis on sond
4. VNTRi ja sondi sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - VNTR vs sond tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on VNTR?

VNTR on lühike nukleotiidijärjestus, mis eksisteerib meie genoomis tandem kordusena. VNTR-id esinevad paljudes kromosoomides. Lisaks erinevad VNTR-id erinevatel isikutel erineva pikkusega, kuna korduste arv on erinevate inimeste VNTR-ides erinev. Põhimõtteliselt on see tingitud vanematelt päritud alleelidest. Seetõttu kasutame VNTR-e peamiselt vanemate tuvastamiseks (päranduseks) või isiklikel eesmärkidel. Samamoodi on neid võimalik kasutada ka geneetikas, kriminalistikas, bioloogilistes uuringutes ja DNA sõrmejälgede võtmisel. Seetõttu on VNTR oluline vahend molekulaarbioloogias.

Joonis 01: VNTR

Pärimisel analüüsime VNTR-i andmeid, kasutades kahte põhiprintsiipi: pärimise sobitamine ja identiteedi sobitamine. Pärandi sobitamise ajal peab inimesel olema iga vanema omaga vastav alleel. Identiteedi sobitamise ajal peavad mõlemad VNTR alleelid olema genoomi konkreetses asukohas.

Mis on sond?

Sond on molekulaarbioloogia kontekstis kunstlikult sünteesitud DNA või RNA fragment pikkusega 100 kuni 1000 alust. Saame neid sonde radioaktiivselt märgistada. Seetõttu kasutame neid sihtnukleotiidijärjestuste tuvastamiseks, mis on komplementaarsed sondi järjestusega. Kui lisame proovidele sondid, toimub hübridiseerumine komplementaarsete järjestuste või sihtjärjestustega ja see teeb sihtmärkjärjestuste tuvastamise meie jaoks lihtsaks. Kuna sondid kannavad radioaktiivsust, saame neid hõlpsalt tuvastada.

Joonis 02: Sond

Kohtuekspertiisis kasutame sondide kasutamist DNA profileerimise tehnikates, näiteks lühikeste tandem-korduspiirkondade tuvastamisel, restriktsioonifragmendi pikkuse polümorfismide tuvastamisel ja DNA sõrmejälgede võtmisel.

Millised on VNTR-i ja sondi sarnasused?

• Nukleiinhapped on VNTR ja Probe ehitusplokid.
• Me kasutame neid geenide tuvastamise protsessides.
• Samuti on nende mõlemad pikkused varieeruvad.
• Need on olulised abivahendid kohtuekspertiisi uuringutes, DNA sõrmejälgede võtmisel, geneetikas jne.

Mis vahe on VNTR-i ja sondi vahel??

VNTR on genoomi piirkond, mis on korraldatud nii, nagu tandem kordub, samal ajal kui sond on lühike DNA või RNA järjestus, mida sünteesitakse kunstlikult, et tuvastada proovis sihtjärjestusi. Niisiis, see on peamine erinevus VNTRi ja sondi vahel. Samuti on oluline erinevus VNTR-i ja sondi vahel selles, et erinevalt VNTR-ist võime sonde radioaktiivselt märgistada.

Veelgi enam, VNTR-id teostavad enamasti vanemlikku identifitseerimist, samal ajal kui sondid aitavad tuvastada DNA või RNA proovides sihtnukleotiidijärjestusi, mis täiendavad sondi järjestust. Seega on see oluline erinevus ka VNTRi ja sondi vahel.

Järgmine infograafik sisaldab rohkem teavet VNTR-i ja sondi erinevuse kohta.

Kokkuvõte - VNTR vs sond

VNTRi ja sondi kasutatakse tavaliselt molekulaarsetes analüüsimeetodites, näiteks kohtuekspertiisi uuringutes ja DNA sõrmejälgede võtmises. Mõlemad koosnevad erineva pikkusega. Peamine erinevus VNTR ja sondi vahel on aga see, et VNTR on genoomi piirkond, mis on paigutatud tandemi kordustega, samas kui sond on DNA või RNA fragment, mida saab radioaktiivselt märgistada. Veelgi enam, VNTR-id esinevad genoomis. Kuid sondid sünteesitakse kunstlikult ja neid saab radioaktiivselt märgistada, et tuvastada DNA- või RNA-proovides sihtnukleotiidijärjestusi, mis täiendavad sondi järjestust. Seega on see kokkuvõte VNTRi ja sondi erinevusest.

Viide:

1. „Muutuv arv tandemikordusi (VNTR) ja selle rakendamine bakteriaalsete epidemioloogiate korral.” Teaduste hoiatus: ajakiri, saadaval siin.
2. “DNA-sond”. Loodusuudised, looduskirjastusgrupp, saadaval siin.

Pilt viisakalt:

1. PaleWhaleGail “D1S80Demo” inglise Vikipeedias (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu
2. “Molecular Beacons” (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia kaudu