Erinevus 16s rRNA ja 16s rDNA vahel

Peamine erinevus - 16 s rRNA vs 16s rDNA
 

Ribosoomid on kõigi elusorganismide valkude sünteesi bioloogilised saidid. Ribosoomid sisaldavad kahte komponenti; väike allüksus ja suur alamühik. Prokarüootsed organismid ja eukarüootsed organismid erinevad nende sisalduva ribosoomi koostisest. Iga alaühik koosneb ribosoomi RNA-st ja erinevatest valkudest. Need kaks alaühikut sobivad kokku ja toimivad valkude sünteesi ajal ühena. Prokarüootsed ribosoomid on 70S ja need koosnevad 30S väikesest subühikust ja 50S suurest subühikust. Eukarüootsed ribosoomid on 80S ja need koosnevad 40S väikesest subühikust ja 60S suurest subühikust. Prokarüootides tuntakse ribosoomide väikese subühiku ribosoomi RNA-d 16s rRNA-na. See 16s rRNA transkribeeritakse kromosomaalsest DNA-st, mida tuntakse kui 16s rDNA. 16s rDNA on geen, mis tekitab transkriptsiooni teel 16s rRNA. võtme erinevus 16s rRNA ja 16s rDNA vahel on see 16s rRNA on transkribeeritud üheahelaline ribosomaalne RNA, mis on prokarüootide väikese subühiku komponent, samas kui 16s rDNA on kaheahelaline kromosomaalne DNA või geen, mis kodeerib 16s rRNA-d. 16-nda rRNA geen on 16-nda rDNA.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on 16s rRNA
3. Mis on 16s rDNA
4. Sarnasused 16-nda rRNA ja 16-nda rDNA vahel
5. Kõrvuti võrdlus - 16 s rRNA vs 16 s rDNA tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on 16s rRNA?

rRNA on ribosoomide komponent. 16s rRNA on prokarüootse ribosoomi 30S väikese subühiku spetsiifiline komponent, mis seondub Shine-Dalgarno järjestusega. See 16-sekundiline rRNA järjestus näitab bakteriliikide vahel suurt varieeruvust. Seega saab seda kasutada bakteriaalse fülogeneesi ja taksonoomia jaoks.

Mis on 16s rDNA?

Prokarüootidel on 70S ribosoome. Prokarüootsete ribosoomide väike subühik on 30S. 30S väikese subühiku ribosoomi RNA (rRNA) on tuntud kui 16s rRNA ja geen 16s rDNA kodeerib seda. Seega on 16s rDNA tuntud kui 16s rRNA geen. 16s rDNA on kromosomaalne DNA. See on kaheahelaline ja see on geen, mis koosneb kodeerivatest ja mittekodeerivatest piirkondadest. Kui 16 s rDNA geen transkribeeritakse, tekitab see 16 s rRNA järjestuse. 16s rDNA on universaalne DNA järjestus prokarüootides. Prokarüootide seas varieerub 16-nda rDNA järjestus. See hõlbustab 16-nda rDNA järjestuse kasutamist bakteriliikide täpseks tuvastamiseks ja ka uute bakteriliikide avastamiseks.

16-ndatel rDNA-l on oluline roll bakterite fülogeneesis ja taksonoomias. Seetõttu kasutatakse seda usaldusväärse molekulaarmarkerina prokarüootide fülogeneetilistes uuringutes, kuna see on erinevate liikide vahel väga konserveerunud. 16-ndal rDNA nukleotiidjärjestusel on üheksa hüpervarieeruvat piirkonda (V1-V9), mis pakuvad head allikat bakterite ja arhaea diferentseerumiseks.

Joonis 01: DNA ja RNA

16-sekundilise rDNA geeni järjestamine on hõlbustanud bakterite ümberklassifitseerimist uutesse liikidesse või perekondadesse. Seetõttu kasutatakse seda geeni molekulaarlaborites kõige tavalisema majapidamismarkerina mikroobide tuvastamiseks. On mitmeid põhjuseid, mis tegid 16srDNA parimaks markeriks mikroobide identifitseerimiseks, näiteks 16srDNA olemasolu kõigis bakterites, 16s rDNA geeni funktsiooni muutumatu olemus aja jooksul ja 16s rDNA suur suurus, mis muudab selle piisavalt teabe saamiseks.

Millised on sarnasused 16-nda rRNA ja 16-nda rDNA vahel?

  • Mõlemad on nukleiinhapped.
  • Mõlemad koosnevad nukleotiididest.
  • Mõlemad on seotud ribosoomi RNA-ga.

Mis vahe on 16-nda rRNA ja 16-nda rDNA vahel?

16s rRNA vs 16s rDNA

16s rRNA on prokarüootide väikese subühiku 30s ribosoomi ribosoomi RNA komponent. 16s rDNA on kromosomaalne DNA, mis kodeerib prokarüootide 16s rRNA järjestust.
 Ahelate arv
16s rRNA on üheahelaline. 16s rDNA on kaheahelaline
Geen või jada
16s rRNA on geeni transkribeeritud RNA. 16s rDNA on geen.
 Kodeerimise järjestus
16-ndatel rRNA-del on ainult kodeeriv järjestus. 16s rDNA-l on nii kodeerivad kui ka mittekodeerivad ahelad.
Uratsiili alus
16 s rRNA sisaldab oma nukleotiidijärjestuses Uratsiili aluseid. 16-nda rDNA nukleotiidijärjestused ei sisalda aluse Uratsiili.
Tümiini alus
16s rRNA ei sisalda oma nukleotiidijärjestuses tümimiinaluseid. 16s rDNA sisaldab oma nukleotiidijärjestuses tümimiinaluseid.
Süntees
16s rDNA geeni transkriptsioonil valmistatakse 16s rRNA. 16s rDNA on prokarüootide genoomis.

Kokkuvõte - 16 s rRNA vs 16s rDNA 

16s rRNA on prokarüootide ribosoomide väikese subühiku ribosoomi RNA komponent. Geen 16s rDNA kodeerib seda RNA järjestust. 16s rRNA on üheahelaline ja 16s rDNA on kaheahelaline. See erinevus on 16s rRNA ja 16s rDNA vahel.

Laadige alla PDF 16s rRNA vs 16s rDNA

Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja seda võrguühenduseta otstarbel kasutada tsitaatide märkuse kohaselt. Laadige alla PDF-versioon siit. Erinevus 16s rRNA ja 16s rDNA vahel

Viide:

1.Janda, J. Michael ja Sharon L. Abbott. "Diagnostikalaboris bakterite tuvastamiseks 16S rRNA geeni järjestamine: plussid, ohud ja lõksud." Ameerika Mikrobioloogia Seltsi kliinilise mikrobioloogia ajakiri, september 2007. Saadaval siin  
2. “Ribosoom”. Vikipeedia, Wikimedia Foundation, 13. jaanuar 2018. Saadaval siin  
3.Woo, PC, et al. "Siis ja nüüd: 16S rDNA geenijärjestuse kasutamine bakterite tuvastamiseks ja uute bakterite avastamiseks kliinilistes mikrobioloogia laborites." Kliiniline mikrobioloogia ja nakkus: Euroopa kliinilise mikrobioloogia ja nakkushaiguste ühingu ametlik väljaanne, USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, oktoober 2008. Saadaval siin 

Pilt viisakalt:

1. 'Diferentsiaalse DNA RNA-EN' autor Sponk (jutt) - tuumabaaside keemilised struktuurid Roland1952 (CC BY-SA 3.0) kaudu Commons Wikimedia