võtme erinevus geneetilise ja füüsilise vahemaa vahel on tüüpi järjestus, mida kasutatakse sama liigi kahe populatsiooni vahelise kauguse analüüsimisel. Geneetiline kaugus mõõdab liikide või liigisiseste populatsioonide vahelist geneetilist erinevust, füüsikaline kaugus mõõdab nukleotiidide arvu kahe markeri vahel.
Geneetiline ja füüsiline kaugus annavad ülevaate liigi kahe populatsiooni vahelistest evolutsioonilistest suhetest. Seetõttu pakuvad kauguskaardid populatsioonide seostamist geneetiliste andmete põhjal. Genoomi järjestamisel ja bioinformaatika analüüsil on oluline roll nii geneetilise kui ka füüsilise vahemaa määramisel.
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on geneetiline kaugus
3. Mis on füüsiline vahemaa
4. Geneetilise ja füüsilise vahemaa sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - geneetiline kaugus vs füüsiline kaugus tabelina
6. Kokkuvõte
Geneetiline kaugus on liikide või populatsioonide vahelise geneetilise erinevuse mõõt. Seda kaugust mõõdetakse esivanemate suhete ja evolutsioonimustrite abil. Geenidevahelise sarnasuse mõõtmisel on oluline geenide sarnasus. Geneetiline kaugus määratleb ka liigi kauguse esivanemani. Pealegi on geneetiliste vahemaade peamine kasutamine kogu maailma populatsioonide vaheliste suhete hindamisel. Seetõttu seob see kogu liigi inimpopulatsioone nende geneetiliste mustrite põhjal.
Geneetiliste vahemaade arvutamine toimub liikide ja kogu populatsioonide geneetilise sarnasuse leidmise teel. Seetõttu mängib bioinformaatika olulist rolli erinevate liikide ja populatsioonide vahelise geneetilise vahemaa määramisel.
Lisaks on erinevaid mudeleid, mis esindavad populatsioonide vahelist geneetilist kaugust. Nende hulka kuuluvad Nei geneetiline kaugus, Cavalli-Sforza ja Edwards mõõdetud väärtus ja Reynoldsi, Weiri ja Cockerhami geneetiline kaugus.
Füüsiline kaugus on kahe liigi või populatsiooni vahelise nukleotiidide arvu mõõtmine. Seega läheb füüsikalise vahemaa arvutamisel mõõtmistase veelgi monomeersemaks. See hõlmab üksikute nukleotiidijärjestuste või tervete genoomide analüüsi tervikuna. Markergeenide vaheline füüsiline kaugus mängib olulist rolli nendevaheliste nukleotiidide arvu määramisel.
Seega, kui kahe populatsiooni füüsiline vahemaa suureneb, suureneb ka geneetiline kaugus. See võib omakorda suurendada ka organismide keerukust. Nii geneetiline kui ka füüsiline kaugus loovad koos evolutsioonilise seose kahe populatsiooni vahel.
Peamine erinevus geneetilise ja füüsilise vahemaa vahel sõltub järjestuse tüübist, mida kasutatakse vahekaardi koostamisel. Geneetiline kaugus on kahe populatsiooni vaheline kaugus seoses geneetilise erinevusega, füüsikaline kaugus mõõdab nukleotiidide vahemaad kahe populatsiooni vahel.
Allpool olev infograafik tähistab lisateavet geneetilise ja füüsilise kauguse vahel.
Geneetiline ja füüsiline kaugus viitavad mõlemad liigi kahe populatsiooni vahelisele evolutsioonilisele ja esivanemate seosele. Seetõttu on mõlemad vajalikud, et jõuda järeldusele evolutsiooniliste vahemaade kohta. Geneetiline kaugus tähistab kahe populatsiooni vahelist kaugust spetsiifiliste geneetiliste markerite suhtes, füüsiline kaugus aga - valitud markergeene ümbritsevate nukleotiidijärjestuste vahelist kaugust. Seega on see peamine erinevus geneetilise ja füüsilise vahemaa vahel.
1. Beaumont, Mark A. jt. “Geneetilise kauguse mõõtmine.” SpringerLink, Springer, Dordrecht, 1. jaanuar 1998, saadaval siit.
2. „Füüsiline kaugus geneetikas”. Elibrary, saadaval siit.
1. “Inimese geenide ajalugu ja geograafia Luigi Luca Cavalli-Sforza kaardi geneetiline” Autor: Blank_map_of_world_no_country_borders.png: Epherti (jutt) tuletustöö: Epherti (jutt) - (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu