Peptiid vs valk
Aminohapetele, peptiididele ja valkudele viidatakse sageli sarnaste terminitena, kuid nende omadused on erinevad. Aminohapped on nii peptiidide kui ka valkude ehitusplokid. Aminohape on väike molekul, mis sisaldab aminorühma (-NH2) ja karboksüülhappe rühm (-COOH), mis on seotud tsentraalse süsinikuaatomiga, täiendava vesiniku ja külgahelaga (R-rühm). See kõrvalahel varieerub kõigi aminohapete vahel; seega määrab see kindlaks iga aminohappe ainulaadsed märgid ja keemia. Konkreetset geenijärjestust kasutatakse nii peptiidide kui ka valkude aminohappejärjestuse määramiseks.
Peptiid
Peptiidid koosnevad kahest või enamast aminohappest, mis on seotud peptiidsidemetega ja esinevad lineaarsete ahelatena. Peptiidi pikkus määratakse aminohapete hulga järgi. Tavaliselt on peptiidi pikkus väiksem kui umbes 100 aminohapet.
Eesliiteid kasutatakse peptiidide tüübi kirjeldamiseks üldterminoloogias. Näiteks kui peptiid koosneb kahest aminohappest, nimetatakse seda dipeptiidiks. Nii ühendatakse kolm aminohapet, saades tripeptiide, neli aminohapet, et saada tetrapeptiide jne. Peale nende tüüpide on veel oligopeptiide (koosnevad 2-20 aminohappest) ja polüpeptiide, milles on palju peptiide (vähem kui 100). Peptiidide kõige olulisemad iseloomulikud tunnused määratakse aminohapete hulga ja järjestuse järgi.
Enamiku peptiidide peamine ülesanne on võimaldada tõhusat suhtlemist, kandes kehas biokeemilisi sõnumeid ühest kohast teise.
Valk
Valgud on bioloogiliste makromolekulide kõige mitmekesisem rühm. Valk koosneb ühest või enamast pikast hargnemata ahelast, mida nimetatakse polüpeptiidideks, kuid valkude ehitusplokid on aminohapped. Aminohappejärjestus määrab valgu peamised omadused, samas kui see aminohappejärjestus on määratletud konkreetse geenijärjestusega.
Tavaliselt on valkudel stabiilsed kolmemõõtmelised struktuurid. Neid struktuure saab arutada neljatasandilise hierarhia alusel; primaarne, sekundaarne, tertsiaarne ja kvaternaarne. Esmane struktuur on valgu aminohappeline järjestus. Sekundaarne struktuur saadakse vesiniksidemete moodustamisel kahe lähedalasuva aminohappe vahel, mille tulemuseks on struktuurid, mida nimetatakse β-kaetud lehtedeks, ja mähised, mida nimetatakse α-heeliksiteks. Seejärel volditakse sekundaarstruktuuri piirkonnad ruumis veelgi, et moodustuks valgu lõplik kolmemõõtmeline struktuur. Mitme polüpeptiidi paigutus ruumis annab tulemuseks valgu kvaternaarse struktuuri.
Valkude peamised funktsioonid on ensüümi katalüüs, kaitse, transport, tugi, liikumine, reguleerimine ja säilitamine.
Mis vahe on peptiidil ja valgul??
• Peptiidid on aminohapete lühikesed lineaarsed ahelad, samas kui valgud on aminohapete väga pikad ahelad.
• Mitu aminohapet on omavahel seotud, moodustades peptiidsidemete abil peptiidi, samas kui mitu peptiidi on omavahel seotud, moodustades valgu molekulid.
• Tavaliselt on valkudel stabiilsed kolmemõõtmelised struktuurid. Seevastu peptiidid ei ole korraldatud stabiilses kolmemõõtmelises struktuuris.
• Peptiidi pikkus on vähem kui umbes 100 aminohapet, samas kui valgu pikkus on üle 100 aminohappe. (On erandeid; seega sõltuvad erinevused pigem molekulide funktsioonist kui nende suurusest)
• Erinevalt peptiididest peetakse valke makromolekulideks.
• Peptiidides moodustavad ainult aminohapete külgahelad vesiniksidemeid. Arvestades, et valkudes moodustavad vesiniksidemeid mitte ainult külgahelad, vaid ka peptiidirühmad. Need vesiniksidemed võivad olla veega või teiste peptiidirühmadega.
• Kõik peptiidid eksisteerivad lineaarsete ahelatena, samas kui valgud võivad eksisteerida primaarsete, sekundaarsete, tertsiaarsete ja kvaternaarsete ahelatena.