Plasmiidi ja kosmiidi erinevus

võtme erinevus plasmiidi ja kosmiidi vahel on see see plasmiid on kaheahelaline, ümmargune ja suletud ekstrakromosomaalne DNA, mis esineb bakterites ja arhaas, samas kui kosmiid on hübriidvektorisüsteem, mis on moodustatud kuna bakterite lambda-faagi ja plasmiidse DNA järjestus.

Geenitehnoloogia on biotehnoloogia valdkonna arenenud uuring. Geenitehnoloogia võib muuta või muuta elusorganismide genoomi. Lisaks on geenitehnoloogia abiks geeniteraapias ja geneetiliste häirete ravis. Enne geenide sisestamist teise organismi genoomi on vaja teha rekombinantne DNA molekul, mis suudab kanda soovitud DNA fragmenti ja toimetada peremeesorganismi. Seetõttu teeb rekombinantse DNA tehnoloogia ajal seda vektorisüsteem. Seega töötab vektor vehiikulina või vahendajana doonori ja peremeesorganismi vahel. Plasmiid ja kosmiid on kahte tüüpi vektorid, mida tavaliselt kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias ja geenitehnoloogias. Mõned neist on looduslikud vektorid, teised aga kunstlikud vektorid. Plasmiid on looduslik vektor, samas kui kosmiid on kunstlikult konstrueeritud vektor. Mõlemal tüübil on plusse ja miinuseid.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on plasmiid
3. Mis on Cosmid
4. Plasmiidi ja kosmiidi sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - tabel Plasmid vs Cosmid
6. Kokkuvõte

Mis on Plasmid?

Plasmiid on väike, ümmargune, kaheahelaline DNA, mis esineb prokarüootsetes organismides peamiselt bakterites ja arheas. Need eksisteerivad bakterite sees suletud ringidena. Samuti ei ole plasmiidid genoomsed DNAd. Seega ei mõjuta plasmiidide olemasolu või puudumine prokarüootsetes rakkudes nende rakkude ellujäämist. Plasmiidid on kromosoomiväline DNA. Kuid plasmiidid pakuvad bakteritele ja arhaeale täiendavaid eeliseid. Need sisaldavad spetsiaalseid geene nagu antibiootikumiresistentsus, resistentsus erinevate raskmetallide suhtes, makromolekulide lagunemine jne.

Lisaks on plasmiidid võimelised ise replitseeruma ilma kromosoomidega seostumata. See kannab geene või teavet, mis on vajalik tema enda replikatsiooniks ja hooldamiseks. Pealegi on nad iseseisev DNA. Nende eripärade tõttu on plasmiidid molekulaarbioloogias vektoritena tohutult kasutatavad.

Joonis 01: Plasmiidid

DNA kaheahelaline olemus, antibiootikumiresistentsuse geenid, iseseisev replikatsioonivõime ja spetsiaalsed restriktsioonisaitid on olulised omadused, mis muudavad plasmiidid rekombinantse DNA tehnoloogias vektormolekulidena sobivamaks. Ja ka plasmiide ​​on kerge eraldada ja muundada peremeesbakteriteks.

Mis on Cosmid?

Kosmiid on hübriidvektorisüsteem. See on kunstlik vektor, mis on konstrueeritud kuna Lambda faagi osakeste järjestused ja plasmiid. Need kuna saidid või järjestused on pikad DNA fragmendid, mis koosnevad 200 aluspaarist. Neil on ühtekuuluvad või kleepuvad otsad, mis võimaldavad plasmiidil sobituda viiruse DNA-ga. Seetõttu on cos-saidid DNA pakendamiseks üliolulised. Seal on kolm cos-saiti, nimelt cosN-sait, cosB-sait ja cosQ-sait. Need saidid hõlmavad DNA ahela nikutamist terminaasi aktiivsuse kaudu, terminaasi hoidmist ja DNA lagunemise ärahoidmist vastavalt DNaaside poolt.

Joonis 02: kosmiid

Kosmiidid võivad kas replitseerida üheahelalise või kaheahelalise DNA, kasutades sobivat replikatsiooni alguspunkti. Need sisaldavad ka antibiootikumiresistentsuse geene, mis võivad olla kasulikud markerid transformeeritud rakkude valimisel. Seega on kosmiidid sarnaselt plasmiididega ka rekombinantse DNA tehnoloogia head vektorid.

Millised on plasmiidi ja kosmiidi sarnasused?

• Plasmiid ja kosmiid on vektorid, mida tavaliselt kasutatakse rekombinantse DNA tehnoloogias.
• Mõlemad suudavad ise paljuneda.
• Neil on replikatsiooni päritolu.
• Lisaks on neil mitu kloonimiskohta.
• Samuti sisaldavad nad antibiootikumiresistentseid geene, mis on kasulikud markeriteks.
• Võõrast DNA saab sisestada mõlemat tüüpi ja sellest saab rekombinantseid molekule.
• Mõlema vektori jaoks on saadaval lihtsad sõelumismeetodid.
• Mõlemad on kasulikud genoomsete raamatukogude konstrueerimisel.

Milline on erinevus plasmiidi ja kosmiidi vahel?

Plasmiid ja kosmiid on kahte tüüpi kloonimisvektorid, mida kasutatakse geenitehnoloogias. Plasmiidid on väikesed, ümmargused kaheahelalised ekstrakromosomaalsed DNA molekulid, mis esinevad bakterites ja arhajas. Teisest küljest on kosmiid hübriidvektor, mis on konstrueeritud lambda-faagi DNA ja plasmiidi DNA cos-järjestustest. See on peamine erinevus plasmiidi ja kosmiidi vahel. Lisaks võivad plasmiidid kanda kuni 25 kb DNA fragmente, samas kui komsiidid suudavad sisaldada kuni 45 kb fragmente. Seega on see veel üks erinevus plasmiidi ja kosmiidi vahel.

Lisateavet saab plasmiidi ja kosmiidi erinevuse infograafikast.

Kokkuvõte - Plasmid vs Cosmid

Plasmiid on looduslikult esinev kromosoomiväline DNA, samas kui kosmiid on faagi DNA ja plasmiidi DNA hübriidvektor. Mõlemad on rekombinantse DNA tehnoloogias kasutatavad kloonimisvektorid. Kosmiidid sisaldavad spetsiaalseid kleepuvaid otsi, mida nimetatakse kos-saitideks in vitro pakend. Teisest küljest sisaldavad plasmiidid mitmeid tunnuseid, mis muudavad need ideaalseteks vektoriteks geenitehnoloogias. Mõlemad võivad läbi viia iseseisva replikatsiooni või in vitro pakendamine bakterirakkudesse. Plasmiidid on võimelised sisaldama 25 kb pikkust võõrast DNA fragmenti, samas kui kosmiidid suudavad sisaldada 45 kb pikkust võõra DNA fragmenti. Seega on kosmiidid kloonimisel kasulikud suuremate DNA fragmentide kloonimiseks, kuna plasmiidsed vektorid ei saa suuremaid fragmente kloonida. Seega võtab see kokku erinevuse plasmiidi ja kosmiidi vahel.

Viide:

1.Loomulised uudised, looduskirjastusgrupp. Saadaval siin  
2. “Cosmid.” NeuroImage, Academic Press. Saadaval siin  

Pilt viisakalt:

1. “Plasmid (inglise keeles)” autor: Spaully - Oma töö, (CC BY-SA 2.5) Commonsi Wikimedia kaudu 
2. “Cosmid (inglise keeles)” autor Zlir'a (CC0) Commons Wikimedia kaudu