Organismidel on kromosomaalne DNA ja kromosoomiväline DNA. Kromosomaalne DNA on pärilikkuse teavet sisaldava geneetilise materjali peamine osa. Organismide jaoks on oluline ka kromosoomiväline DNA; prokarüootides omab kromosoomiväline DNA erilisi geene, näiteks resistentsus antibiootikumide suhtes, resistentsus erinevate raskmetallide suhtes ja makromolekulide lagunemine. Plasmiid ja episoom on organismide kahte tüüpi ekstrakromosomaalsed DNAd. Plasmiidid on suletud, ümmargused ja kaheahelalised bakterite DNAd. Episoom on veel üks organismide suhteliselt suurem kromosoomiväline DNA liik. Peamine erinevus plasmiidi ja episoodi vahel on see plasmiidid ei suuda sulanduda bakteriaalse kromosomaalse DNA-ga samas episoomid on võimelised integreeruma kromosomaalse DNA-ga.
SISU
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on plasmiid
3. Mis on episoom
4. Kõrvuti võrdlus - Plasmid vs Episome
5. Kokkuvõte
Plasmiid on väike ümmargune kaheahelaline DNA. Bakterid sisaldavad täiendava kromosomaalse materjalina plasmiide. Plasmiidid on võimelised ise paljunema ilma kromosoomidega seostumata. Nad kannavad geene või teavet, mis on vajalik selle replikatsiooniks ja hooldamiseks. Seetõttu peetakse neid iseseisvaks DNA-ks.
Plasmiidid on väga väikesed. Need eksisteerivad bakterite sees suletud ringidena. Plasmiidid sisaldavad bakterite hädavajalikke geene. Need geenid kodeerivad bakteritele kasulikke erijooni, näiteks antibiootikumiresistentsus, makromolekulide lagundamine, raskmetallide taluvus ja bakteriotsiinide tootmine.
Plasmiide on vektorites molekulaarbioloogias tohutult kasutatud. DNA kaheahelaline olemus, antibiootikumiresistentsuse geenid, iseseisev replikatsioonivõime ja spetsiaalsed restriktsioonisaitid on olulised omadused, mis tegid plasmiidid rekombinantse DNA tehnoloogias vektormolekulidena sobivamaks. Plasmiide on ka kerge eraldada ja muundada peremeesbakteriteks.
Joonis 01: Plasmiidid
Episoom on ekstrakromosomaalne geneetilise materjali tükk, mis võib mõnda aega eksisteerida iseseisva DNAna ja integreeritud kujul organismi genoomsesse DNA-sse veel mõnda aega. Episome peetakse ebaolulisteks geneetilisteks elementideks. Need on enamasti pärit viirusest või mõnest teisest bakterist väljaspool peremeesorganismi. Nad võivad siseneda peremeesorganismi ja eksisteerida kromosoomivälise DNAna ning hiljem integreeruda genoomse DNA-ga ja paljuneda. Kui need eksisteerivad integreerimata üksustena, hävitatakse peremeesrakk. Integreerimise korral toodetakse episoomide uued koopiad ja edastatakse need ka tütarrakkudesse.
Episome saab plasmiididest eristada suurema suuruse tõttu. Mõned näited hõlmavad insertsioonijärjestusi, bakterite F-faktorit ja teatud viirusi.
Joonis 02: episoomid
Plasmiid vs episood | |
Plasmiid on väike, ümmargune, kaheahelaline ekstrakromosomaalne DNA molekul. | Episoom on teatud tüüpi kromosomaalne DNA, mis on suurem kui plasmiidid. |
Võimalus ennast korrata | |
See sisaldab vajalikku teavet enese reprodutseerimiseks. | See ei sisalda teavet enese reprodutseerimiseks. |
Seos kromosomaalse DNA-ga | |
Nad ei suuda ühenduda bakterite kromosomaalse DNA-ga. | Neid saab integreerida kromosomaalse DNA-ga. |
Spetsiaalne geenide kodeerimine | |
Mõned plasmiidides asuvad geenid pakuvad bakteritele eripära, näiteks resistentsus antibiootikumide suhtes, raskmetallide taluvus jne. | Episoomid ei sisalda spetsiaalseid geene. F-plasmiid sisaldab ainult F-faktori DNA-d. |
Kasutage vektoritena | |
Vektoritena kasutatakse plasmiide. | Episome ei kasutata vektoritena. |
Episoom ja plasmiid toimivad bakterite kromosoomivälise DNA-na. Plasmiidid on isereplitseeruvad väikesed ümmargused DNA molekulid, millel on sellised eripärad nagu antibiootikumiresistentsus jne. Plasmiide kasutatakse vektorina rekombinantse DNA tehnoloogias. Plasmiidid ei suuda integreeruda bakterite kromosoomi. Episoom on veel üks bakterite kromosoomivälise DNA tüüp. Nad on võimelised integreeruma bakteri kromosoomidesse ja kanduma replikatsiooni ajal tütarrakkudesse. Need on suuremad kui plasmiidid sisaldavad rohkem aluspaare. See on erinevus plasmiidide ja episoomide vahel.
Viited:
1. Abbas, Wasim. “Episoomid”. Dna-, kromosoomi-, geneetilised ja host - JRank artiklid. N.p., n.d. Võrk. 8. aprill 2017
2. Couturier, M., F. Bex, P. L. Bergquist ja W. K. Maas. "Bakteriaalsete plasmiidide identifitseerimine ja klassifitseerimine." Mikrobioloogilised ülevaated. USA Riiklik Meditsiiniraamatukogu, september 1988. Veeb. 8. aprill 2017
3. Bennett, P. M. “Plasmiid kodeeris antibiootikumiresistentsust: antibiootikumiresistentsuse geenide omandamine ja ülekandmine bakterites.” Briti ajakiri farmakoloogiast. Looduskirjastusgrupp, märts 2008. Veeb. 8. aprill 2017