Erinevus proteoomika ja metaboolika vahel

võtme erinevus proteoomika ja metaboomika vahel on see proteoomika on organismi kõigi valkude, samal ajal kui metaboomika on kõigi organismi metaboliitide uurimine.

Genoomika on organismi geneetilise koostise uurimine. Proteoomika ja metaboomika on kaks genoomikaga seotud omiteadust. Proteoom viitab kõigile raku või organismi valkudele. Metabolome viitab seevastu kõigile organismi metaboliitidele. Seega on proteoomi uurimine proteoomika, samas kui metaboomi uurimine on metabomeetika. Nii proteoomika kui ka metaboomika on olulised haiguste diagnoosimisel ning organismide iseloomustamisel ja sõeluuringul. Veelgi enam, mõlemad on ühendatud rakubioloogia paljudes aspektides, eriti raku signaliseerimisel, valkude lagundamisel ja genereerimisel ning translatsioonijärgsel modifitseerimisel.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on proteoomika
3. Mis on ainevahetus
4. Sarnasused proteoomika ja metaboolika vahel
5. Võrdlus kõrvuti - proteoomika vs metaboolika tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on proteoomika?

Proteoom on raku, koe või organismi kogu valgukomplement. Seetõttu on proteoomika organismi proteoomi uurimine. Proteoomikas analüüsitakse valkude erinevaid omadusi. Seetõttu keskendub proteoomika peamiselt valkude struktuurile, orientatsioonile, funktsioonidele, valkude vastasmõjudele, modifikatsioonidele, rakendustele ja valkude tähtsusele. Sellepärast viiakse praegu proteoomika valdkonnas läbi palju uurimisprojekte.

Escherichia coli proteiinisisalduse tuvastamiseks tehti esimesed proteoomilised uuringud. Valgu üldsisalduse kaardistamiseks kasutati kahemõõtmelisi (2D) geele. Pärast selle projekti edukust liikusid teadlased edasi selliste loomade nagu merisead ja hiired üldvalgu sisalduse kirjeldamisse. Praegu tehakse inimese valkude kaardistamiseks 2D geelelektroforees.

Proteoomika uurimisel on palju eeliseid, kuna valgud on valkude katalüsaatori omaduste tõttu kõige aktiivsemad juhtivad molekulid. Seega võib tervete valkude uurimine anda teavet organismi tervisliku seisundi kohta. Lisaks on proteoomikal palju rakendusi genoomi annoteerimisel, haiguse tuvastamisel ja diagnostikas, valkude ekspressiooniuuringute läbiviimisel katsete ajal ning valkude modifitseerimise ja interaktsiooni uuringutel jne..

Joonis 01: Proteoomika

Proteoomikaga on seotud erinevad tehnikad, sealhulgas koguvalgu ekstraheerimine, nende eraldamine 2D-geelelektroforeesi abil, ekstraheeritud valkude sekveneerimine selliste meetoditega nagu Edmundi sekveneerimismeetod või massispektromeetria ning valgu struktuursete ja funktsionaalsete omaduste analüüsimine, kasutades arvutipõhine tarkvara ja bioinformaatika tööriistad.

Mis on ainevahetus?

Metabolomics on kõigi metaboliitide uurimine rakus, koes või organismis. See hõlmab rakuliste metaboliitide identifitseerimist ja kvantifitseerimist, kasutades erinevaid arenenud analüütilisi ja statistilisi vahendeid. Metaboloomika on oluline uuring, kuna see paljastab teavet organismi metabolismi kohta.

Joonis 02: Ainevahetus

Ainevahetusreaktsioonide substraatide ja saaduste uurimiseks kasutab metaboomika analüütilise platvormina massispektromeetriat. Massispektromeetria abil saadakse metaboliidid ja nende kontsentratsioonid, mis kajastavad rakkude või kudede tegelikku biokeemilist seisundit. Seega võib metaboomikat pidada organismi molekulaarse fenotüübi parimaks esindajaks. Lisaks neile võib metaboomikat käsitleda ka proteoomika laiendusena, kuna enamik metaboliite tekitatakse valkude ensüümide aktiivsuse tõttu.

Millised on sarnasused proteoomika ja metaboolika vahel?

• Proteoomika ja metaboomika on kaks genoomikaga seotud omiteadust.
• Ainevahetust saab pidada proteoomika laiendusena.
• Proteoom ja metaboom on paljude uuringutega tihedalt seotud.

Mis vahe on proteoomikal ja metaboolikal??

Proteoomika on valkude laiaulatuslik uurimine, sealhulgas nende struktuur ja funktsioon rakus või organismis. Samal ajal on metaboomika metaboliidi profiilide uurimine rakus, koes või organismis antud tingimustes. Niisiis, see on peamine erinevus proteoomika ja metaboomika vahel. Pealegi puudutab proteoomika peamiselt kogu valkude komplekti, samas kui metaboomika puudutab peamiselt kogu metaboliitide komplekti, sealhulgas mitmesuguseid väikeseid molekule, nagu peptiidid, süsivesikud, lipiidid, nukleosiidid ja eksogeensete ühendite kataboolsed tooted jne. Seetõttu on see teine ​​erinevus proteoomika ja metaboomika vahel.

Allpool toodud infograafik võtab kokku erinevused proteoomika ja metaboomika vahel.

Kokkuvõte - proteoomika vs metaboolika

Elusorganisme saab uurida nende genoomi, valkude ja metaboliitide abil. Genoomika, proteoomika ja metaboomika on kolm valdkonda, kus uuritakse vastavalt raku või organismi geneetilist koostist, valke ja metaboliite. Proteoomika on oluline, kuna see on nii geenide kui ka keskkonna dünaamiline peegeldus. Metaboloomika on väga oluline, kuna see peegeldab otseselt rakkude biokeemilise reaktsiooni hetkeseisu või organismi metaboolset seisundit. Seega võtab see kokku proteoomika ja metaboomika erinevuse.

Viide:

1. P, Surat. “Kuidas on metabool ja proteoom omavahel seotud?” Uudised, 26. veebruar 2019, saadaval siin.
2. Horgan, Richard P ja Louise C Kenny. SAC tutvustas Omic Technologies: genoomikat, transkriptoomikat, proteoomikat ja metaboomikat. " Sünnitusabi ja günekoloogia, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18. juuli 2011, saadaval siit.

Pilt viisakalt:

1. “Proteomics” Xxl7441 poolt inglise keeles Wikibooks - üle viidud saidilt en.wikibooks Commonsi. (Avalik domeen) Commonsi Wikimedia kaudu
2. Metaboomika skeem Lmaps (vestlus) - ma lõin selle teose täiesti ise (CC BY-SA 3.0) Commonsi Wikimedia kaudu