RNASE A ja RNASE H erinevus

Peamine erinevus - RNASE A vs RNASE H
 

Ribonukleaasid on nukleaasid, mis lagundavad RNA spetsiifiliselt väiksemateks ühikuteks. Neid võib jagada kahte kategooriasse; endoribonukleaasid ja eksoribonukleaasid. Endoribonukleaas on endonukleaas, mis võib lagundada kas üheahelalisi või kaheahelalisi RNA-sid. See lõhustab RNA polünukleotiidahelas olevaid fosfodiestersidemeid. Nendeks näideteks on RNaas A, RNaas III, RNaas T1, RNaas P ja RNaas H. Eksoribonukleaas on eksonukleaas, mis lagundas RNA, eemaldades RNA molekuli kas 5'- või 3'-otsast terminaalsed nukleotiidid. Näited on RNaas R, RNaas II, RNaas D ja RNaas PH. võtme erinevus RNASE A ja RNASE H vahel on, et RNaas A on pankrease ribonukleaas, mis lagundab spetsiifiliselt üheahelalise RNA väiksemateks komponentideks, samas kui RNase H on mittespetsiifiline ensüüm, mis lõhestab RNA-DNA hübriidi RNA hüdrolüütilise mehhanismi kaudu väiksemateks ühikuteks.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on RNASE A?
3. Mis on RNASE H
4. Sarnasused RNASE A ja RNASE H vahel
5. Võrdlus kõrvuti - RNASE A vs RNASE H tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on RNASE A?

RNaas A on kõhunäärme ribonukleaas, mis lõhustab spetsiifiliselt paarimata tsütosiini ja uratsiili jäägid üheahelaliste RNA 3'-otsas. RNaas H töötab kõrgema soolakontsentratsiooni korral (0,3 M või suurem NaCl kontsentratsioon). Hüdrolüütiline reaktsioon on kahes etapis. See moodustab 2 ', 3' tsüklilise monofosfaadi vaheühendi kaudu 3 'fosforüülitud produkti. Ehkki see on spetsiifiline kõrgema soolakontsentratsiooni korral üheahelaliste RNA-de suhtes, võib see madalama NaCl kontsentratsiooni korral (alla 0,3 M NaCl) lagundada ka kaheahelalist RNA-d ja RNA-d RNA-DNA hübriidides..

Esmalt sünteesis seda ensüümi Bruce Merrifield. RNaas A on molekulaarsetes uuringutes väga populaarne ensüüm. Veiste pankrease RNaas A on näide RNaasist A. Ja see on üks kõvemaid ensüüme, mida laboris kasutatakse. See ensüüm ei vaja oma tegevuseks kofaktorit. See on väga termostabiilne ensüüm. RNaas A on esimene ensüüm ja kolmas valk, millele detekteeriti õige aminohappejärjestus. See ensüüm on väga väike, sisaldades 124 aminohapet ja molekulmassiga 12600da. Ja sellel on neli histidiinijääki (His 12 ja His 119, mis hõlmavad katalüütilist reaktsiooni).

Joonis 01: RNaas A

RNaasi A saab eraldada toorproovi keetmise teel. Keemise ajal lagundavad kõik muud ensüümid järelejäänud RNaasi A. RNaas A on hämmastavalt stabiilne ensüüm. See ensüüm pärsib ribonukleaasi inhibiitori valgu, raskemetalli ja uridiinvanadaadi komplekse.

Mis on RNase H?

RNaas H on mittespetsiifiline ribonukleaasi ensüüm, mis suudab RNA-d hüdrolüütilise reaktsiooni abil RNA-DNA hübriidis lagundada. RNaas H lõhustab RNA 3'-O-P sideme RNA-DNA hübriidis. Lõppkokkuvõttes toodab see 3'OH ja 5 'fosfaadiga lõpetatud tooteid. DNA replikatsioonis mängib see pöördelist rolli, eemaldades RNA praimeri pärast uute DNA ahelate moodustumist. Laboratoorsetes tingimustes lagundab see spetsiifiliselt RNA RNA-DNA hübriidis, kuid mitte DNA-d ja hübridiseerimata RNA-d. Ja seda ensüümi kasutatakse tavaliselt RNA matriitsi hävitamiseks pärast esimese komplementaarse DNA ahela moodustumist cDNA sünteesi käigus.

Joonis 02: RNaas H

RNase H kasutatakse ka nukleaasikaitsetestides. Seda saab kasutada ka polü-A saba eemaldamiseks mRNA-st. RNaas H on võime hävitada mittekodeeriva RNA rakus ja väljaspool seda. Metalliioonid on selle valguaktiivsuse jaoks vajalikud. RNase H ensüümi pärssimiseks võib kasutada kelaatijat (EDTA).

Millised on sarnasused RNASE A ja RNASE H vahel?

• Mõlemad on valgu olemusega.
• Mõlemad on endoribonukleaasid
• Mõlemad võivad RNA-d lagundada.
• Mõlemad viivad läbi hüdrolüütilisi reaktsioone.
• Molekulaarlaborid kasutavad neid kahte.

Mis vahe on RNASE A ja RNASE H vahel??

RNASE A vs RNASE H
RNaas A on kõhunäärme ribonukleaas, mis lõhustab spetsiifiliselt kõrgema soolakontsentratsiooni korral üheahelalise RNA paarimata tsütosiini ja uratsiili jäägid 3'-otsa.	RNaas H on mittespetsiifiline ribonukleaasi ensüüm, mis võib hüdrolüütilise reaktsiooni kaudu RNA-d RNA-DNA hübriidis lagundada.
RNA lõhustumise olemus
RNaas A lõhustab spetsiifiliselt kõrgema soolakontsentratsiooni korral üheahelalisi RNA-sid.	RNase H lõhustab RNA RNA-DNA hübriidis.
Tegevuse kaasfaktorite vajadus
RNase A ei vaja oma tegevuseks kofaktoreid.	RNase H vajab oma tegevuseks kofaktorina metalliioone.
Valguaktiivsuse inhibiitorid
Ribonukleaasi inhibiitori valgu, raskemetalli ja uridiini vanadaadi kompleksid pärsivad RNAaasi A aktiivsust.	Kelaator (EDTA) pärsib RNaasi H aktiivsust.
RNA praimeri eemaldamine DNA replikatsioonis
RNaasi A ei kasutata RNA praimeri eemaldamiseks DNA replikatsioonis.	RNaasi H kasutatakse RNA praimeri eemaldamiseks DNA replikatsioonis
DNA mallide eemaldamine komplementaarses DNA (C-DNA) sünteesis
RNaasi A ei kasutata RNA matriitsi eemaldamiseks komplementaarse DNA (C-DNA) sünteesi ajal.	RNaasi H kasutatakse RNA matriitsi eemaldamiseks komplementaarse DNA (C-DNA) sünteesi ajal.
Polü-A-saba eemaldamine Oligo-ga hübridiseeritud mRNA-st (dt)
RNaasi A ei kasutata "polü-A saba" eemaldamiseks mRNA-st, mis on hübridiseeritud oligo (dt).	RNaasi H kasutatakse „polü-A saba” eemaldamiseks mRNA-st, mis on hübridiseerunud oligo (dt)

Kokkuvõte - RNASE A vs RNASE H

Ribonukleaasid on nukleaasensüümid, millel on võime lõhustada RNA väiksemateks ühikuteks. Neid on kahte tüüpi; endoribonukleaasid ja eksoribonukleaasid. Endoribonukleaas on endonukleaas, millel on võime lagundada üheahelalist või kaheahelalist RNA-d. Ja see lõhustab fosfodiestersideme RNA polünukleotiidahelas. RNaas A ja RNaas H on kaks endoribonukleaasi. RNaas A on kõhunäärme ribonukleaas, mis lõhustab spetsiifiliselt paarimata tsütosiini ja uratsiili jääke üheahelaliste RNA 3'-otsas suurema soolakontsentratsiooni korral. RNaas H on mittespetsiifiline ribonukleaasi ensüüm, mis võib RNA-d hüdrolüütilise reaktsiooni kaudu RNA-d lagundada. See on erinevus RNaas A ja RNaas H vahel.

Laadige alla PDF RNASE A vs RNASE H

Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja seda võrguühenduseta otstarbel kasutada tsitaatide märkuse kohaselt. Palun laadige alla siit PDF-versioon. Erinevus RNASE A ja RNASE H vahel

Viide:

1.Karuturi, autor Amrutha. “17 peab teadma RNase A kohta käivat fakti.” AG ajaveeb, 22. veebruar 2017. Saadaval siin
2. “Ribonukleaas”. Vikipeedia, Wikimedia Foundation, 5. jaanuar 2018. Saadaval siin  

Pilt viisakalt:

1.'RNase A'By Masinloetavat autorit ei esitatud. Vossman oletas (autoriõiguse väidete alusel), (CC BY-SA 2.5) Commonsi Wikimedia kaudu
2.'RNase H fix'By Masinloetavat autorit ei pakuta. Vossman oletas (autoriõiguse väidete alusel), (CC BY-SA 2.5) Commonsi Wikimedia kaudu