Erinevus aktiivse saidi ja siduva saidi vahel

võtme erinevus aktiivse saidi ja sidumissaiti vahel on see aktiivne sait soodustab keemilise reaktsiooni katalüüsi, samas kui seondumiskoht aitab ligandi seondumist suure molekuliga.

Sidumiskoht on valgu, DNA või RNA piirkond, millega ligand saab seonduda. Ensüümid on valgud. Aktiivne sait on ensüümi piirkond, millega substraadid võivad keemilise reaktsiooni toimumiseks seostuda. Sellel konkreetsel piirkonnal on ka sidumissait koos katalüütilise saidiga. Seetõttu aitavad seondumiskohad ainult ligandi sidumisel suure molekuliga, samas kui aktiivsed saidid soodustavad nii ligandi sidumist suure molekuliga, lastes sellel toimuda katalüüsitud keemilisel reaktsioonil.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on aktiivne sait
3. Mis on sidumiskoht
4. Kõrvuti võrdlus - aktiivne sait vs siduv sakk tabelina
5. Kokkuvõte

Mis on aktiivne sait?

Aktiivne sait on ensüümi piirkond, millega keemilise reaktsiooni substraadid seonduvad, et läbi viia katalüüsitud keemiline reaktsioon. see piirkond koosneb kahest alampiirkonnast kui sidumissait ja katalüütiline sait. Sidumiskoht sisaldab jääke, mis võivad aidata substraadil (reagentidel) ensüümi siduda. Katalüütiline sait aitab keemilist reaktsiooni katalüüsida. Pealegi on see piirkond ensüümi kogu ruumalaga võrreldes väga väike; umbes 10-20% kogu ensüümi mahust.

Joonis 01: Aktiivse saidi sidumis- ja katalüütiline sait

Tavaliselt sisaldab aktiivne sait 3-4 aminohapet. ülejäänud ensüümi aminohapped, mis osalevad ensüümi tertsiaarse struktuuri säilitamisel. Veelgi olulisem on see, et aktiivsel saidil on konkreetne disain, mis sobib konkreetse aluspinnaga. Seetõttu reageerivad need ensüümid ainult teatud substraatidega. Kuid mõnikord vajavad ensüümid oma funktsiooniks kofaktoreid. Aktiivse saidi peamine ülesanne on vähendada keemilise reaktsiooni aktiveerimisenergiat, suurendades sellega reaktsiooni kiirust.

Mis on siduv sait?

Sidumiskoht on valgu, DNA või RNA piirkond, millega ligandid võivad seonduda. Seal võib ligand selle saidiga moodustada keemilise sideme. Need piirkonnad näitavad eripära; konkreetne ligand seondub kindla sidumiskohaga. Seetõttu on see sait mõõdetav liganditüüpide osas, mis võivad molekuliga seostuda.

Lisaks kasutame neid piirkondi sageli biomolekulide funktsionaalseks iseloomustamiseks. Näiteks võime iseloomustada aktiivse saidi funktsionaalsust selle sidumissaidi kaudu. Veelgi enam, DNA puhul on spetsiifiliseks sidumiskohaks transkriptsioonifaktori sidumissait, mis asub DNA-s.

Mis vahe on aktiivsel saidil ja siduval saidil??

Aktiivne sait on ensüümi piirkond, millega keemilise reaktsiooni substraadid seonduvad selleks, et läbi viia katalüüsitud keemiline reaktsioon, samas kui seondumissait on valgu, DNA või RNA piirkond, millega ligandid võivad seostuda. See on peamine erinevus aktiivse saidi ja sidumissaiti vahel. Veelgi enam, aktiivsed saidid esinevad ensüümides ja need aitavad suurendada konkreetse keemilise reaktsiooni reaktsioonikiirust, vähendades selle reaktsiooni aktiveerimise energiabarjääri. Sidumiskohad vastutavad spetsiifilise ligandi sidumise eest kindla molekuliga.

Allpool toodud infograafik näitab aktiivse saidi ja sidumissaiti erinevust tabelina.

Kokkuvõte - aktiivne sait vs siduv sait

Aktiivsed saidid on ensüümide piirkonnad, mis võivad keemilise reaktsiooni reaktsioonikiirust suurendada, vähendades selle reaktsiooni aktiveerimise energiabarjääri. Sidumiskoht on mis tahes piirkond, millega ligand saab seonduda. Aktiivne sait sisaldab ka sidumissaiti. Erinevus aktiivsete ja sidumissaitide vahel sõltub olemasolu ja funktsionaalsusest. Seetõttu on peamine erinevus aktiivse saidi ja sidumissaiti vahel selles, et aktiivne koht aitab keemilise reaktsiooni katalüüsi, samas kui sidumiskoht aitab ligandi sidumisel suure molekuliga.

Viide:

1. “Aktiivne sait”. Vikipeedia, Wikimedia Foundation, 24. juuli 2018. Saadaval siin 
2. “Sidumiskoht”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 28. august 2018. Saadaval siin 

Pilt viisakalt:

1. „Ensüümstruktuur” - autor Thomas Shafee - Oma töö, (CC BY 4.0) Commons Wikimedia kaudu