Protomeeride ja kapsomeeride erinevus

võtme erinevus protomeeride ja kapsomeeride vahel on see protomeerid on oligomeersete valkude struktuuriüksused, samal ajal kui kapsomeerid on üksikud valgud, mis koosnevad protomeeridest, mis on viiruse kapsiidi struktuuriühikud.

Viirus on rakusisene kohustuslik parasiit, mis on nakkav osake. Kapsiid on üks kahest viiruseosakese põhikomponendist. See on valgukate, mis ümbritseb ja kaitseb viiruse genoomi. Kapsiid koosneb protomeeridest, mis on oligomeersete valkude struktuuriüksused. Capsomere on viiruse kapsiidi struktuurne subühik ja see koosneb mitmest protomeerist kui ühikust. Seega protomeerid ise koonduvad kapsomeetri moodustamiseks ja kapsomeerid ise kokku kapsiidi moodustamiseks.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on protomeerid 
3. Mis on kapsomeetrid?
4. Protomeeride ja kapsomeeride sarnasused
5. Võrdlus kõrvuti - protomeerid vs kapsomeetrid tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on protomeerid?

Protomeerid on oligomeersete valkude struktuuriüksused. Protomeer sisaldab vähemalt kahte erinevat polüpeptiidahelat. Sagedamini sisaldavad need mitmeid polüpeptiide. Viiruskapsides moodustuvad protomeerid ise, moodustades kapsomeere, mis on kapsiidide morfoloogilised ühikud. Protomeerid ühenduvad üksteisega spetsiifiliste sidemete kaudu ja ise koonduvad.

Joonis 01: Protomeerid

Tubaka mosaiikviiruses agregeeruvad protomeerid, moodustades RNA genoomi ümbritsemiseks kahekihilise ketta. Seega moodustavad need tubaka mosaiikviiruse protomeerid lõpuks pika jäiga õõnsa toru, mis annab sellele spiraalse välimuse. Ikoosaedrilise sümmeetria korral liituvad protomeerid viieks või kuueks kapsomeeriks koosnevateks ühikuteks ja kondenseeruvad seejärel võrdkülgsete kolmnurkade 20 küljeks ja 20 tipuks.

Mis on Capsomeres??

Kapsomeerid on viiruse kapsiidi strukturaalsed valgu alaühikud. Nad on ka viiruste morfoloogilised alaühikud. Struktuuriliselt on kapsiid kapsomeeride kogum. Igal kapsomeeril on mitu protomeeri, mis on omavahel ise kokku pandud. Veelgi enam, kapsomeerid on kapsiidis paigutatud erinevalt, et saada viiruse kapsiidile kuju. Sellega seoses on viiruste puhul kolm tüüpi kapsomeerseid paigutusi spiraalne, ikosaedne ja keeruline. Kapsomeeride paigutus on aga konkreetse viiruse jaoks iseloomulik. Kapsomeerid liituvad üksteisega kapskapomeersete triplekside kaudu, mis koosnevad ühest valgu kahest ja teisest koopiast.

Joonis 02: kapsomeetrid

Lisaks on igal viirusel piiratud arv kapsomeere. B-hepatiidi viirusel on 180 kapsomeeri sisaldav ikosaedne kapsiid. Rekombinantsel adenoviirusel on kapsiid, mis sisaldab 252 kapsomeeri. Herpesviiruste kapsiidides on 162 kapsomeeri. Veelgi enam, enteroviiruse kapsiidis on 60 kapsomeeri. Samuti on erinevatel viirustel valgu kestades erinev arv kapsomeere.

Capsomeres täidavad viiruste puhul mitmeid funktsioone. Kapsomeerid kaitsevad viiruse genoomi füüsikaliste, keemiliste ja ensümaatiliste kahjustuste eest. Lisaks on kapsomeerid olulised viiruse genoomi viimisel peremeesorganismi, adsorbeerudes kergesti peremeesraku pindadele.

Millised on protomeeride ja kapsomeeride sarnasused?

• Protomeerid ja kapsomeerid on valgu struktuurid.
• Protomeerid on kapsomeeride alaühikud, samas kui kapsomeerid on viiruse kapsiidi alaühikud.
• Nii protomeerid kui ka kapsomeerid saavad ise kokku panna.

Mis vahe on protomeeridel ja kapsomeeridel??

Protomeerid on struktuuriüksused, mis moodustavad oligomeerseid valke, kapsiomeerid aga viiruse kapsiidide morfoloogilised ühikud. Niisiis, see on peamine erinevus protomeeride ja kapsomeeride vahel. Lisaks agregeeruvad protomeerid kapsomeeride moodustamiseks, samas kui kapsomeerid agregeeruvad kapsiidide moodustamiseks.

Allpool on infograafik kokku võetud protomeeride ja kapsomeeride erinevusest.

Kokkuvõte - protomeerid vs kapsomeetrid

Protomeerid on kapsomeeride alaühikud, samas kui kapsomeerid on viiruse kapsiidi valgu alaühikud. Seega on kapsomeer protomeeride agregatsioon, kapsiid aga kapsomeeride agregatsioon. Protomeeride või kapsomeeride paigutus annab kindla viiruse kuju või sümmeetria. Kapsomeerse paigutuse põhjal on spiraalsed ja ikosaedrid viiruste puhul nähtavad kaks kuju või sümmeetriat. Niisiis, see võtab kokku protomeeride ja kapsomeeride erinevuse.

Viide:

1. “Capsid”. Vikipeedia, Wikimedia Foundation, 3. september 2019, saadaval siin.

Pilt viisakalt:

1. „Viiruse kapsiidide T-number” - autorid Ranjan V. Mannige ja Charles L. Brooks III - Mannige RV, Brooks CL III, 2010 „Viiruse kapsiidide perioodiline tabel: mõju looduslikule valikule ja kujundamisele.” PLOS ONE 5 (3): e9423. doi: 10.1371 / journal.pone.0009423 (CC BY 2.5) Commonsi Wikimedia kaudu
2. „Adenoviiruse 3D skeem” - autor Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) - Omad tööd (CC BY-SA 4.0) Commonsi Wikimedia kaudu